Offre de stage de Master 2 – Écologie et conservation
-Lieu : Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249, Université Marie et Louis Pasteur / CNRS), Besançon (25)
-Partenaire : Conservatoire d’espaces naturels de Franche-Comté (CEN Franche-Comté)
-Encadrement : Hugo Sentenac, enseignant-chercheur, Maître de Conférences, Chrono-environnement
-Niveau : Master 2 – Écologie, biodiversité, conservation ou formation équivalente
-Début : Février–mars 2027
-Financement : En cours de confirmation
-Contexte et objectifs :
Le Sonneur à ventre jaune (Bombina variegata) est un amphibien protégé, dont les populations sont notamment menacées par la dégradation et la fragmentation de leurs habitats (statut UICN : VU en France, NT en Franche-Comté). Comprendre les mécanismes qui déterminent la dynamique de ses populations est essentiel pour orienter les stratégies de conservation.
En collaboration avec le CEN Franche-Comté, ce stage vise à analyser plus de 12 années de données de capture-marquage-recapture (CMR) photographique (à noter qu’il n’y a pas de marquage ici, les patterns ventraux permettant une identification individuelle), collectées dans la Réserve naturelle nationale du Ravin de Valbois (Doubs), afin de caractériser la dynamique démographique d’une population de Sonneurs à ventre jaune et d’évaluer ses perspectives de persistance.
-Missions et méthodes
Le stage reposera principalement sur l’analyse de données longitudinales et la modélisation démographique :
• Organisation et exploitation des données de CMR photographique (identification individuelle).
• Analyses statistiques et modèles de capture-recapture pour estimer les paramètres démographiques : abondance, survie apparente, probabilités de détection, recrutement.
• Modélisation de la dynamique de population par Matrix Population Modelling (MPM) et interprétation des résultats dans une perspective de conservation.
• Participation aux suivis de terrain dans la réserve, incluant la surveillance sanitaire des amphibiens.
• Initiation aux analyses moléculaires en laboratoire (extraction d’ADN, qPCR) pour la détection de pathogènes des amphibiens.
Selon les opportunités, des sessions de terrain supplémentaires pourront être organisées en Franche-Comté dans le cadre d’un programme régional de surveillance des maladies des amphibiens.
-Profil recherché: Étudiant(e) de Master 2, ou équivalent, avec un intérêt marqué pour l’écologie des populations et la conservation de la biodiversité. Des connaissances en statistiques et en programmation sous R sont souhaitées. Un intérêt pour le travail de terrain et les approches quantitatives est attendu.
-Contact : Hugo Sentenac – Laboratoire Chrono-environnement, Besançon. hugo.sentenac@umlp.fr
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