Intitulé du stage : Du comportement individuel à l’agrégation en mer : Modéliser l’abondance des oiseaux marins autour des navires de pêche à partir des données d’observateurs embarqués.
Laboratoires d’accueil : Observatoire Pelagis (UAR 3462 CNRS / La Rochelle Université) & Centre d’Études Biologiques de Chizé (CEBC – UMR 7372 CNRS / La Rochelle Université).
Lieu principal : Accueil hybride basé à La Rochelle (site des Minimes / Pelagis) et au CEBC (Chizé).
Encadrement :
• Florian Orgeret (Enseignant-Chercheur Contractuel, CEBC – encadrant principal)
• Camille Santaniello (Doctorante, CEBC / Sentirisk)
• Jérôme Spitz, Ghislain Dorémus & Sophie Laran (Observatoire Pelagis)
Contexte scientifique :
Les navires de pêche et leurs rejets constituent une ressource trophique majeure pour les oiseaux marins opportunistes. Si le suivi individuel par biologging permet d’estimer des seuils d’attraction comportementale à fine échelle, il ne quantifie pas directement la taille des rassemblements effectifs. Ce stage vise à analyser la dynamique d’agrégation des oiseaux marins en mer en exploitant les réseaux de comptages visuels et d’observateurs embarqués (programmes Obsmer, campagnes Mégascope « suiveurs » et survols Pelagis) dans le golfe de Gascogne.
Objectifs & Missions :
• Structuration des données : Nettoyage et préparation des jeux de données d’observations embarquées.
• Modélisation statistique : Quantifier l’effet des phases de pêche (chalutage, virage de filet, rejets), du type de métier, de la saisonnalité et de l’environnement sur les effectifs d’oiseaux à l’arrière des navires à l’aide de Modèles Additifs Généralisés (GAM / GAMM adaptés aux données sur-dispersées sous R).
• Mise en miroir : Confronter les prédictions d’abondance aux lois d’attraction individuelles extraites du projet Sentirisk (thèse en cours).
• Valorisation : Rédaction du rapport de stage de M2 en vue d’une publication scientifique.
Profil recherché :
• Étudiant·e en Master 2 (Écologie quantitative, Biostatistiques, Écologie marine).
• Solides compétences en programmation et modélisation sous R (tidyverse, sf, GAM/GAMM).
• Fort intérêt pour l’écologie spatiale, marine et de la conservation.
• Rigueur, autonomie et bonnes capacités rédactionnelles (français et anglais).
Conditions :
• Durée : 6 mois (période flexible entre janvier et juillet selon cursus).
• Gratification : Base légale (~600 €/mois, financement ANR ExcelLR / Sentirisk).
• Environnement : Poste de travail dédié, accès aux serveurs et dépôts du laboratoire.
Modalités de candidature :
Envoyer un fichier PDF unique intitulé M2_Abondance_NOM_Prénom.pdf comprenant :
• CV (max. 2 pages)
• Lettre de motivation (1 page)
• Relevés de notes de M1 et M2
• Contacts de deux référents
• (Optionnel) Un court exemple de script ou rapport R
📧 À adresser à : florian.orgeret@univ-lr.fr
📅 Date limite : 31 octobre 2026 (ou au fil de l’eau jusqu’au recrutement)
🔗 Fiche complète du stage : https://www.sentirisk.org/Pelagis-CEBC-Stage-M2-Orgeret.pdf
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