Offre de STAGE : le rôle des chevreuils dans l’épidémiologie de la maladie de Lyme

Niveau : Master 2 en écologie de la santé, césure, ou 3e année d’ingénieur en agronomie.

Equipe d’accueil : INRAE-CEFS, 24 chemin de Borde Rouge, 31320 Castanet Tolosan

Encadrement : Vincent Bourret (chercheur) et Ugo Herpin (doctorant)

Période : 5 à 6 mois à partir du 15 mars 2026

Contexte scientifique :
La maladie de Lyme, due à l’infection par la bactérie Borrelia burgdorferi sl., touche environ 50000 personnes par an en France, avec des conséquences handicapantes à long terme. La transmission de Borrelia par les tiques du genre Ixodes constitue une problématique de santé publique, notamment pour les usagers de la nature et des milieux agricoles.
Si l’infection par Borrelia constitue un risque pour l’Homme, d’autres hôtes de tiques sont connus pour être « non-compétents » à cette bactérie, c’est-à-dire que Borrelia ne peut pas se développer dans l’organisme de l’hôte (Martin et al., 2016). C’est le cas du chevreuil européen (Capreolus capreolus) (Jaenson & Tälleklint, 1992). Des études ont même montré que le sérum des cervidés semble avoir la capacité innée d’inactiver les Borrelia dans des conditions in vitro (Pearson et al., 2023).
Nous nous demandons si cet effet se vérifie également dans des conditions naturelles, et si les échanges biochimiques entre les cervidés et leurs tiques permettent de « nettoyer » les tiques de Borrelia. Les cervidés pourraient ainsi contribuer, par effet dilution (Occhibove et al., 2022), à la réduction de la prévalence (proportion de tiques infectées) de Borrelia dans les tiques.
Le chevreuil est le cervidé le plus abondant en France et utilise une grande variété d’habitats, notamment les milieux agricoles(Rigoudy et al., 2024). Il constitue aussi un hôte important de tiques, à tous les stades de développement du parasite (Vor et al., 2010). Les populations de chevreuils pourraient avoir un impact localement sur la prévalence de Borrelia dans le paysage.

Objectifs du stage :
L’objectif du stage sera dans un premier temps de déterminer si le fait que le chevreuil est parasité par les tiques permet de neutraliser Borrelia dans l’organisme des tiques. Pour cela, nous avons récolté des tiques libres dans l’environnement et des tiques fixées sur des chevreuils, ces dernières ayant en principe été exposées à davantage de sérum de chevreuil. Nous prédisons que la prévalence de Borrelia dans les tiques de l’environnement sera supérieure à la prévalence de Borrelia dans les tiques prélevées sur les chevreuils. Pour cela, des extractions d’ADN et des PCR quantitatives visant à évaluer la charge en bactéries dans les tiques sont en cours.
Dans un deuxième temps, l’objectif sera de déterminer l’impact du chevreuil sur la prévalence de Borrelia à l’échelle du paysage. Une approche sera de vérifier si la prévalence de Borrelia dans les tiques récoltées dans les prairies peu attractives pour le chevreuil est supérieure à la prévalence de Borrelia dans les tiques récoltées dans les prairies très attractives pour le chevreuil. Nous disposons pour cette partie de tiques prélevées dans la végétation d’une grande diversité de prairies, censées présenter des ressources plus ou moins intéressantes pour les chevreuils. Cette partie s’inscrit dans le cadre de la thèse de Ugo Herpin, qui étudie des liens entre l’attractivité des prairies pour les chevreuils et le risque acarologique des maladies à tiques dans les prairies.

Missions principales du / de la stagiaire :
– Acquisition de données sur l’infection des tiques par Borrelia, par extraction d’ADN de tiques et PCR en laboratoire.
– Analyses statistiques sur les données d’infection des tiques, pour déterminer si le chevreuil permet de réduire la prévalence de Borrelia dans les tiques.
– Rédaction scientifique du rapport de stage, et participation possible à une publication sur le rôle du chevreuil dans l’épidémiologie de la maladie de Lyme.
– Possibilité de participer à du travail de terrain (captures de chevreuils en janvier et février 2026, collectes de tiques).

Profil requis :
Appétence pour le travail de paillasse (extraction ADN, PCR) et l’analyse statistique. Intérêt pour la thématique one health.

Rémunération : Environ 600 €/mois

Modalités de candidature :
Envoyer un CV et une lettre de motivation à Vincent Bourret (vincent.bourret@inrae.fr), Ugo Herpin (ugo.herpin@inrae.fr) et Hélène Verheyden (helene.verheyden@inrae.fr) au plus tard le 5 janvier 2026.

Bibliographie :
Jaenson TGT, & Tälleklint L. (1992). Incompetence of Roe Deer as Reservoirs of the Lyme Borreliosis Spirochete. Journal of Medical Entomology, 29(5), 813‑817. tps://doi.org/10.1093/jmedent/29.5.813
Martin LB, Burgan SC, Adelman JS & Gervasi SS. (2016). Host Competence: An Organismal Trait to Integrate Immunology and Epidemiology. Integrative and Comparative Biology, 56(6), 1225‑1237. https://doi.org/10.1093/icb/icw064
Occhibove F, Kenobi K, Swain M & Risley C. (2022). An eco‑epidemiological modeling approach to investigate dilution effect in two different tick‑borne pathosystems. Ecological Applications, 32(3), e2550. https://doi.org/10.1002/eap.2550
Pearson P, Rich C, Feehan MJR, Ditchkoff SS & Rich SM. (2023). White-Tailed Deer Serum Kills the Lyme Disease Spirochete, Borrelia burgdorferi. Vector-Borne and Zoonotic Diseases, 23(5), 303‑305. https://doi.org/10.1089/vbz.2022.0095
Rigoudy N, Chamaillé‑Jammes S, Hewison AJM, Bonnet A, Chaval Y, Lourtet B, Merlet J & Morellet N. (2024). Crop phenology reshapes the food‑safety landscape for roe deer in an agroecosystem. Journal of Applied Ecology, 61(3), 564‑574. https://doi.org/10.1111/1365-2664.14581
Vor T, Kiffner C, Hagedorn P, Niedrig M & Rühe F. (2010). Tick burden on European roe deer (Capreolus capreolus). Experimental and Applied Acarology, 51(4), 405‑417. https://doi.org/10.1007/s10493-010-9337-0

Le contenu de cette offre est la responsabilité de ses auteurs. Pour toute question relative à cette offre en particulier (date, lieu, mode de candidature, etc.), merci de les contacter directement. Un email de contact est disponible: ugo.herpin@inrae.fr

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