Intitulé du stage : Étude de la diversité génétique du cormier (Cormus domestica) en France
Intitulé du poste : stage pour étudiant.e de niveau équivalent Master 2
Type de contrat : stage
Rémunération : selon grille salariale de l’INRAE
Date de prise de fonction : A définir, idéalement démarrage février 2026
Durée : 6 mois selon possibilités
Unité d’accueil : Unité de recherche INRAE Ecologie des Forêts méditerranéennes
https://ecologie-des-forets-mediterraneennes.paca.hub.inrae.fr/
Equipe d’accueil : Axe disciplinaire : Biologie des populations et évolution (BioPopEvol)
Lieu d’exercice : Domaine Saint-Paul, site Agroparc. Route de l’aérodrome. 84914 AVIGNON Cedex 9
Contact : Caroline Scotti-Saintagne (caroline.scotti-saintagne@inrae.fr).
Ce stage portera sur l’étude de la diversité génétique et de la structuration des populations de cormier (Cormus domestica) à l’échelle nationale, en vue de constituer une collection de conservation des ressources forestières.
Objectifs du stage
• Caractériser la diversité génétique et la structuration génétique de 1000 arbres de cormier échantillonnés dans toute la France. Pour cela, des modèles de génétique des populations seront utilisés, en s’appuyant notamment sur les logiciels Structure (Pritchard et al., 2000) et le package Adegenet sous R.
• Comparer la diversité génétique entre des individus naturels en milieu forestier et d’autres situés dans des paysages anthropisés (villages, zones bocagères, jardins, etc.), afin d’évaluer l’impact des usages humains passés sur la distribution actuelle de la diversité génétique.
• Constituer une « core collection » : à partir des 1000 arbres analysés, identifier un sous-ensemble représentatif d’une centaine d’individus, permettant de refléter la diversité génétique et sa structuration à l’échelle de la France.
Cette base de données servira à orienter les actions de conservation et pourra contribuer à la création de vergers à graines destinés au reboisement.
Contexte et enjeux
Le cormier, autrefois largement exploité pour ses fruits, a très probablement vu sa diversité génétique influencée par les pratiques humaines (plantations, greffage, sélection locale…). La comparaison entre populations forestières et non forestières permettra d’évaluer cet impact sur la structuration génétique actuelle. Les résultats générés constitueront un socle essentiel pour des recherches futures, notamment celles portant sur l’adaptation au changement climatique. Ce stage s’inscrit dans le cadre du projet de science participative CORMIER 3R https://www.cormier-sorbusdomestica.com/copie-de-le-cormier, dans lequel d’autres volets (réponses à la sécheresse, qualité des fruits, etc.) dépendent des résultats génétiques obtenus
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