Depuis plusieurs décennies, les plans d’eau naturels du littoral aquitain sont colonisés par plusieurs espèces de plantes exotiques envahissantes, et notamment deux hydrocharitacées que sont Lagarosiphon major et Egeria densa. Ces espèces ont des impacts socio-économiques et environnementaux importants sur les écosystèmes et font régulièrement l’objet de différentes mesures de gestion. Mais, à l’échelle des plans d’eau, avoir une idée de la biomasse des herbiers et de leur fluctuation temporelle reste un véritable défi. Les approches émergentes d’ADN environnemental (ADNe) pourraient contribuer à une meilleure quantification des plantes à l’échelle du lac.
Avec l’objectif à plus long terme de pouvoir mettre en place une méthode moléculaire permettant d’estimer la biomasse des herbiers, il s’agirait, dans un premier temps, de gagner de la connaissance sur la structure génétique de ces espèces à l’échelle régionale. Ces connaissances permettront ensuite de choisir les outils moléculaires appropriés pour l’utilisation de l’ADNe dans la quantification de la biomasse.
L’objectif du stage est de contribuer à évaluer la structure génétique de L. major et E. densa dans les lacs aquitains. Il s’agira notamment de développer les marqueurs permettant l’analyse génétique des plantes ciblés et d’effectuer le génotypage de ces espèces.
Le/la stagiaire devra :
– réaliser un travail bibliographique notamment sur l’historique d’introduction de ces espèces dans les plans d’eau du littoral aquitain et sur la connaissance génétique de ces espèces ;
– mettre en place le protocole de prélèvement des plantes sur le terrain ;
– développer les marqueurs génétiques (microsatellites) sur ces espèces et les génotyper par séquençage ;
– analyser les données génétique pour évaluer la structuration génétique des espèces au regard de l’historique d’invasion.
LE PROFIL QUE NOUS RECHERCHONS
** Formation recommandée : Étudiant(e) en Master 2 ou École d’Ingénieur, orienté(e) écologie des communautés, biologie des populations et génétique.
**Le (la) stagiaire doit être capable de :
– réaliser le travail de terrain ;
– mettre en œuvre les techniques de laboratoire et d’analyses bioinformatique et statistique pour l’analyse des échantillons ;
– rédiger de documents (rapports, présentations orales) ;
– travailler de manière autonome et en équipe.
** permis de conduire de plus d’un an bienvenu.
VOTRE QUALITE DE VIE À INRAE
Le stage sera réalisé en collaboration forte avec la Plateforme Génome Transcriptome de Bordeaux (PGTB, UMR BIOGECO) et nécessitera donc des déplacements fréquents entre les sites de Cestas-Gazinet et Cestas-Pierroton.
En rejoignant INRAE, vous pourrez bénéficier selon le type de contrat :
• Poste de travail fourni
• Frais de mission pris en charge au tarif administratif
• Prise en charge possible de l’abonnement transports en commun domicile-travail, à raison de 75% et sur justificatifs
• Restauration collective disponible à un tarif « stagiaire »
• Droit à congé de 2,5 jours par mois de stage effectué.
**Modalités d’accueil
– Unité:UR EABX, INRAE site de Gazinet-Cestas (Gironde)
– Code postal + ville : 33612 Gazinet Cestas
– Type de contrat : stage
– Durée du contrat : 6 mois
** Rémunération : Gratification mensuelle à raison de 4,35 € par heure de stage effectuée et par jour de présence (soit ≈ 600€ net/mois pour un temps complet). Taux 2025 non connu à ce jour.
** Modalités pour postuler
Transmettre une lettre de motivation et un CV à :
Aurélien Jamoneau, Olivier Lepais
Par e-mail :
aurelien.jamoneau@inrae.fr
olivier.lepais@inrae.fr
** Date limite pour postuler : 31/10/2025
Commentaires récents