Sujet de stage de Master 2 : Impact de la pression de pêche sur la diversité fonctionnelle des communautés benthiques de sédiments grossiers de la Manche
Encadrant principal :
Nom, prénom : PEZY Jean-Philippe, chargé de recherches CNRS
Laboratoire : UMR Morphodynamique Continentale et Côtière (M2C)
Mél. / tel : jean-philippe.pezy@unicaen.fr / 06 23 80 68 21
Co-encadrants :
Nom, prénom : VAN PAEMELEN Robin
Laboratoire : UMR Morphodynamique Continentale et Côtière (M2C)
Mél. / tel : robin.vanpaemelen@unicaen.fr
Nom, prénom : THIEBAUT Éric
Laboratoire : Sorbonne Université, Station marine de Roscoff
Mél. / tel : eric.thiebaut@sb-roscoff.fr
Lieu du stage :
Laboratoire d’accueil : Laboratoire M2C, (Morphodynamique Continentale et Côtière, UMR CNRS, 24 rue des Tilleuls, F-14000 CAEN)
Localisation : Normandie Université UNICAEN, Esplanade de la Paix, 14032 Caen, France
Période du stage : Premier semestre 2026
Durée du stage : 6 mois
Présentation du stage (Mission, Activités, Compétences requises)
Contexte du stage
La Manche est un écosystème soumis à de nombreuses perturbations anthropiques (développement des énergies marines renouvelables, extraction de granulats…) et naturelles (fort hydrodynamisme, événements extrêmes). Ces pressions interviennent dans un contexte de changement climatique et modifient la structure des communautés benthiques. L’une des particularités de la Manche est d’être composée à plus de 80 % de sédiments grossiers, qui restent encore peu étudiés de manière quantitative. Ces habitats sont le lieu de nombreuses pressions historiques telles que l’extraction de granulats et la pêche par les engins traînants et sont généralement reconnus pour être résilients. Actuellement, au niveau de ces habitats, de nombreuses pressions émergentes s’ajoutent telles que le développement des énergies marines renouvelables avec les parcs éoliens.
Traditionnellement, ces habitats sont étudiés au niveau spécifique, à partir de données semi-quantitatives et plus récemment à l’aide de données quantitatives afin d’évaluer la réponse fonctionnelle de ces écosystèmes aux pressions naturelles et anthropiques (diversité spécifique, abondance, biomasse). Ces approches considèrent que la diversité spécifique et l’abondance des communautés benthiques sont une mesure implicite de la diversité fonctionnelle mais ne prennent pas en compte les traits biologiques gouvernant les processus écologiques au sein de ces communautés benthiques. Un trait biologique se définit comme une caractéristique morphologique, comportementale, physiologique ou décrivant l’histoire de vie d’une espèce (Violle et al., 2007 ; Beauchard et al., 2017 ; Martini et al., 2021). Récemment, différentes études ont mis en avant l’utilisation de différents traits biologiques afin d’évaluer de façon explicite la diversité fonctionnelle. L’analyse des traits biologiques donne donc des informations sur le fonctionnement de l’écosystème en reliant les paramètres abiotiques et la structure de la communauté (Bremmer et al., 2006 ; Bolam & Eggleton, 2014). Certains traits biologiques, aussi appelés trait fonctionnel réponse, changent le long d’un gradient environnemental ou d’un gradient de pression, en réponse aux variations des paramètres abiotiques (Bolam & Eggleton, 2014). L’analyse des traits biologiques est complémentaire de l’analyse taxonomique et permet de comparer des habitats différents ou géographiquement distants car elle ne tient pas compte de la taxonomie (et n’est pas sensible à la présence d’espèces endémiques ou spécifiques à un habitat) (Bolam & Eggleton, 2014).
Objectifs scientifiques
L’objectif principal du stage sera d’évaluer les impacts de la pêche aux arts trainants sur la diversité fonctionnelle des habitats benthiques. Pour cela, il s’agira de mobiliser un vaste jeu de données de communautés macrozoobenthiques déjà acquises, et de les coupler à des données de pression de pêche issues de la base SACROIS (données d’effort déclarées par les professionnels, couvrant l’ensemble des arts traînants). Plusieurs études récentes dans différents habitats benthiques sédimentaires ont ainsi montré comment l’analyse des traits fonctionnels permettait de décrire l’impact des activités de pêche et d’identifier des indicateurs de sensibilité (Gonzalez-Irusta et al., 2018 ; Hiddink et al., 2020 ; Beauchard et al., 2021 ; Serrano et al., 2022).
Plus précisément, le/la stagiaire devra :
– Compléter une matrice de traits fonctionnels des espèces de la macrofaune benthique de substrats grossiers de la Manche, en intégrant notamment des traits liés à leur sensibilité ou à leur résilience face aux perturbations physiques.
– Caractériser la diversité fonctionnelle des communautés benthiques à l’aide d’une approche basée sur les traits biologiques (Biological Traits Analysis).
– Analyser les impacts de la pêche de fond sur la structure fonctionnelle des communautés, en évaluant les changements dans l’occupation de l’espace fonctionnel et dans différentes métriques de diversité fonctionnelle (FRic, FEve, FDiv, RaoQ).
– Mettre en relation la pression de pêche et la diversité fonctionnelle afin d’identifier les mécanismes de réponse et d’évaluer la résilience des communautés benthiques face aux gradients d’effort de pêche.
Ce travail stage s’inscrit dans le cadre de la thèse de Robin Van Paemelen intitulée « Diversité fonctionnelle des communautés benthiques des sédiments grossiers de la Manche » et contribuera à améliorer la compréhension des effets de la pêche de fond non seulement sur la composition taxonomique, mais aussi sur le fonctionnement écologique des habitats benthiques.
Profil du candidat recherché
Ce stage s’adresse à un(e) étudiant(e) de Master 2 possédant de bonnes connaissances en écologie marine et un intérêt marqué pour l’analyse de données appliquée. Des connaissances en écologie benthique et en écologie fonctionnelle constitueraient un atout. Le/la candidat(e) devra avoir une solide maîtrise des analyses de données sous R, notamment en analyses multivariées, ainsi qu’une bonne maîtrise des outils SIG (QGIS ou ArcGIS).
Autonomie, rigueur scientifique et goût pour le travail en équipe sont attendus, de même que de bonnes capacités rédactionnelles, d’analyse et de synthèse.
Références bibliographiques
Beauchard, O., Veríssimo, H., Queiros, A.M., Herman, P.M.J., 2017. The use of multiple biological traits in marine community ecology and its potential in ecological indicator development. Ecol. Indic. 76, 81–96. https://doi.org/10.1016/j.ecolind.2017.01.011
Beauchard, O., Brind’Amour, A., Schratzberger, M., Laffargue, P., Hintzen, N. T., Somerfield, P. J., & Piet, G. (2021). A generic approach to develop a trait-based indicator of trawling-induced disturbance. Marine Ecology Progress Series, 675, 35–52. https://www.jstor.org/stable/27107368
Bolam, S.G., Coggan, R.C., Eggleton, J., Diesing, M., Stephens, D., 2014. Sensitivity of macrobenthic secondary production to trawling in the English sector of the Greater North Sea: a biological trait approach. J. Sea Res. 85, 162–177. https://doi.org/10.1016/j.seares.2013.05.003
Bremner, J., Rogers, S.I., Frid, C.L.J., 2006. Matching biological traits to environmental conditions in marine benthic ecosystems. J. Mar. Syst. 60, 302–331. https://doi.org/10.1016/j.jmarsys.2006.02.004
Gonzalez-Irusta, J.M., De la Torriente, A., Punzo´n, A., Blanco, M., and Serrano, A. Determining and mapping species sensitivity to trawling impacts: the BEnthos Sensitivity Index to Trawling Operations (BESITO). – ICES Journal of Marine Science, 75: 1710–1721. https://doi.org/10.1093/icesjms/fsy030
Hiddink, J.G., Kaiser, M.J., Sciberras, M., McConnaughey RA, Mazor T, Hilborn R, Collie JS, Pitcher CR, Parma AM, Suuronen P, Rijnsdorp AD, Jennings S (2020) Selection of indicators for assessing and managing the impacts of bottom trawling on seabed habitats. J Appl Ecol 57:1199–1209 https://doi.org/10.1111/1365-2664.13617
Martini, S., et al., 2021. Functional trait-based approaches as a common framework for
aquatic ecologists. Limnol. Oceanogr. 66, 965–994. https://doi.org/10.1002/lno.11655
Serrano, A., de la Torriente, A., Punzón, A., M. Blanco, Bellas, J., Durán-Muñoz, P., Murillo F.J., Sacau, M. , García-Alegre, A., Antolínez, A., Elliott, S., Guerin, L., Vina-Herbón, C., Marra, S., González-Irusta, J.M, Sentinels of Seabed (SoS) indicator: Assessing benthic habitats condition using typical and sensitive species, Ecological Indicators, Volume 140, 2022, 108979, ISSN 1470-160X, https://doi.org/10.1016/j.ecolind.2022.108979
Violle, C., Navas, M.L., Vile, D., Kazakou, E., Fortunel, C., Hummel, I., Garnier, E., 2007. Let the concept of trait be functional. Oikos 116 (5), 882–892. https://doi.org/10.1111/j.0030-1299.2007.15559.x
Candidature
Envoyer un CV et une lettre de motivation avant le XX à : jean-philippe.pezy@unicaen.fr, robin.vanpaemelen@unicaen.fr et eric.thiebaut@sb-roscoff.fr
Commentaires récents