Contexte
Le projet de recherche SOUTERRE (étude de la diversité et de la dynamique spatio-temporelle de la faune des eaux SOUTerraines pour évaluer les Echanges nappes-Rivières et la qualité biologique des aquifèREs) a démarré fin 2024. Il est issu d’une collaboration entre les laboratoires ECODIV (https://ecodiv.univ-rouen.fr) et M2C (https://m2c.cnrs.fr) de l’Université de Rouen et une thèse a démarré sur ce travail au 1er Octobre 2024. Ce projet devrait permettre d’une part de décrire les communautés de la faune aquatique souterraine présentes dans les aquifères de la craie en Normandie et de caractériser les facteurs biotiques et abiotiques qui régissent l’assemblage de ces communautés. Un focus se fera particulièrement sur le genre Niphargus, des amphipodes présents dans tous les sites étudiés en Normandie et qui sont particulièrement intéressants du fait de leur dispersion active et de leur position en haut de la chaine alimentaire dans les écosystèmes souterrains. Une base de données existe déjà sur les traits fonctionnels des Niphargidae et servira de modèle pour des mesures réalisées lors du stage au laboratoire à Rouen (Premate et Fiser, 2024). L’objectif sera de comparer les traits des individus entre les différents sites en Seine-Maritime, et potentiellement avec d’autres régions si les données le permettent, afin de voir s’il y a des différences entre individus issus de sites différents et si oui, si des caractéristiques environnementales et géologiques différentes peuvent alors influencer les traits des individus.
Objectifs du stage :
Ce stage est proposé pour un(e) étudiant(e) de Master 1 et pour une durée de 3 mois et pourra débuter entre début avril et mi-avril 2025 en fonction de la disponibilité du (de la) candidat(e). Le ou la stagiaire participera à l’acquisition des mesures de traits grâce à un logiciel Leica et une caméra reliée à une loupe binoculaire. Il ou elle participera aux premières analyses de ces traits en lien avec des facteurs environnementaux. Un échantillonnage sur le terrain peut être envisagé si d’autres individus sont nécessaire pour les analyses mais n’est pas garanti. Une aide pour les identifications moléculaires à l’espèce en cours peut être également demandée au (à la) candidat(e).
Ce stage sera encadré par Louise Lejosne (Doctorante, laboratoire ECODIV) et co-encadré par Aurélie Husté (Maître de conférences, HDR, Laboratoire ECODIV). Le ou la stagiaire sera accueilli(e) au laboratoire ECODIV de l’Université de Rouen.
Travaux à réaliser durant le stage :
– Mesure de traits fonctionnels sous loupe binoculaire,
– Analyses statistiques de diversité de traits et mise en lien avec des facteurs environnementaux,
– Échantillonnage sur le terrain possible
Pré-requis :
– Intérêt pour l’étude des traits fonctionnels et les invertébrés aquatiques
– Analyses statistiques avec le logiciel R,
– Des connaissances de base des manipulations en laboratoire moléculaire seraient un plus.
Durée du stage, type de financement, perspectives et lieu :
Le stage aura lieu au laboratoire ECODIV de l’Université de Rouen Normandie. Il est prévu pour une durée de 3 mois. Le stage sera rémunéré selon les conditions légales en vigueur, les déplacements de terrain potentiels seront pris en charge par le laboratoire ECODIV
Contacts :
Les candidatures (CV & lettre de motivation) sont à envoyer avant le 15 mars 2026 à Louise Lejosne (louise.lejosne@univ-rouen.fr) ET Aurélie Husté (aurelie.huste@univ-rouen.fr).
Bibliographie :
Premate, E., & Fišer, C. (2024). Functional trait dataset of European groundwater Amphipoda : Niphargidae and Typhlogammaridae. Scientific Data, 11(1), 188. https://doi.org/10.1038/s41597-024-03020-w
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