Contexte et Enjeux. Les forêts tempérées fournissent de nombreux services écologiques et économiques essentiels, mais leur capacité d’adaptation face au changement climatique suscite de vives inquiétudes. La pérennité de ces écosystèmes repose principalement sur leur régénération naturelle, elle-même conditionnée par le mode de reproduction des arbres. Chez de nombreuses espèces forestières, la reproduction est caractérisée par d’importantes variations interannuelles et une forte synchronisation des arbres dans leur production de graines — un phénomène appelé masting ou « pluie de graines ». De ce phénomène dépendent fortement la dynamique des consommateurs de graines, la circulation de zoonoses (ex. la maladie de Lyme) et le succès du recrutement forestier.
Les chênes tempérés constituent un modèle d’étude privilégié : leurs populations présentent des dynamiques de fructification extrêmement fluctuantes, marquées par de fréquentes années à glandée nulle. La récurrence de telles années suggère l’action combinée de multiples facteurs, parmi lesquels des «vétos environnementaux » agissant en interaction sur le niveau de la fructification. L’impact de ces blocages météorologiques étant amené à évoluer fortement avec le changement climatique, démêler ces mécanismes complexes constitue une priorité pour anticiper les trajectoires de régénération des chênaies en Europe dans les décennies à venir.
Objectifs du stage. L’objectif principal du stage est d’identifier les différents vétos environnementaux responsables de l’absence de fructification certaines années dans les chênaies (facteurs météorologiques bloquant le développement des fleurs en fruits à différents stades, de l’induction florale à la maturation) et de décrypter leurs interactions.
Cette problématique sera traitée grâce à une base de données de terrain originale issue d’un suivi longitudinal mené depuis 2012 sur 150 chênes sessiles répartis sur 15 sites en France métropolitaine (10 arbres par population, couvrant des contextes climatiques variés). L’originalité majeure de ce jeu de données réside dans l’évaluation annuelle, pour chaque arbre, de l’abondance des structures reproductrices femelles et de leur distribution selon 7 catégories de développement et stades d’avortement, permettant d’isoler les facteurs météorologiques bloquant chaque stade.
Approche méthodologique. Le travail reposera sur l’analyse statistique des séries temporelles de floraison et fructification via une modélisation multiniveau sous R (modèles linéaires généralisés mixtes – GLMM, approches de type Random Forest et TreeSHAP). Les variables météorologiques conditionnant chaque stade de développement devront être détectées et hiérarchisées. Selon l’avancée des analyses, les mécanismes mis en évidence pourront être intégrés dans un modèle mécaniste de masting déjà opérationnel afin d’analyser leurs effets sur la trajectoire du phénomène entre 1960 et 2020.
Ce stage permettra de développer de solides compétences en analyse de données écologiques et météorologiques, en modélisation statistique de séries temporelles, ainsi qu’en écologie fonctionnelle de la reproduction forestière.
Informations pratiques
Programme de recherche : Ce stage s’inscrit dans le cadre du programme PEPR FORESTT (PC REGE-ADAPT) et de l’ANR REGEMAST.
Durée : 6 mois (année universitaire 2026-2027)
Établissement de rattachement : Université Claude Bernard Lyon 1, Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive (LBBE)
Encadrement :
Marie-Claude Venner (MCU, Univ. Lyon 1 — marie-claude.venner@univ-lyon1.fr)
Samuel Venner (MCU, Univ. Lyon 1 — samuel.venner@univ-lyon1.fr)
Profil recherché : Master 2 en écologie/biostatistiques avec de solides bases en analyse statistique de données et en écologie scientifique.
Candidature : Envoyer CV, lettre de motivation et lettre(s) de recommandation.
Références récentes de l’équipe encadrante sur le sujet
• Fleurot, E., … Bel‐Venner, M. C., & Venner, S. (2026). Oak masting under climate change: when spatially heterogeneous shifts in flowering phenology reshape pollen limitation. New Phytologist.
• Fleurot, E., … Bel‐Venner, M. C., & Venner, S. (2024). Reconciling pollen limitation theories: insights from temperate oak masting. Ecology Letters, 27(11), e70009.
• Fleurot, E., … Bel‐Venner, M. C., & Venner, S. (2023). Oak masting drivers vary between populations depending on their climatic environments. Current Biology, 33(6), 1117-1124.
• Schermer, E., Bel‐Venner, M. C., … & Venner, S. (2020). Flower phenology as a disruptor of the fruiting dynamics in temperate oak species. New Phytologist, 225, 1181-1192.
• Schermer, E., Bel‐Venner, M. C., …, & Venner, S. (2019). Pollen limitation as a main driver of fruiting dynamics in oak populations. Ecology Letters, 22, 98-107.
Commentaires récents