Stage rémunéré – Possibilité de poursuite en thèse
Informations pratiques
– Date de début : 1er janvier 2026 (flexible) ; Durée : 6 mois
– Candidature (CV + lettre de motivation) à adresser à : jean-christophe.poggiale@univ-amu.fr ;
martin.daufresne@inrae.fr ; arnaud.sentis@inrae.fr ; yann.voituron@univlyon1.
fr
-date limite pour candidater: 28 octobre
– Localisation du stage: UMR RECOVER, Aix-en-Provence
Co-superviseurs : Jean-Christophe Poggiale (MIO, Marseille), Martin Daufresne
(RECOVER, INRAE Aix), Arnaud Sentis (RECOVER, INRAE Aix), Yann Voituron
(LEHNA, Lyon)
Contexte scientifique
Le changement climatique ne se résume pas à une simple hausse des températures
moyennes ! Il s’accompagne d’une augmentation spectaculaire de la variabilité thermique
rendant les conditions de vie moins prévisibles pour les organismes (Easterling et al., 2000).
Or, jusqu’à récemment, c’est principalement la question de la dérive des températures
moyennes qui a monopolisé l’effort de recherche. Cela conduit à une probable sousestimation
de l’impact réel de ce changement global et des projections sur le maintien des
populations erronées (Burggren, 2019 ; Slein et al., 2023 ; Vasseur et al., 2014).
Face à ces nouvelles contraintes, les organismes répondent par des déplacements différents
à travers les habitats thermiques. Des poissons utilisent par exemple des refuges froids en
été et des refuges chauds en hiver. De telles observations ont récemment été faîtes (i) dans
des populations d’ombre commun (voir photo) dans la rivière Ain pour les premiers refuges
et (ii) dans la rivière Buèges, pour le second type de refuges, où des bancs massifs de
cyprinidés (principalement ablette, gardon et chevesne) ont été observés.
Qu’elle soit spatiale ou temporelle, la variation thermique reste largement sous-estimée
dans la recherche actuelle et n’est pas pris en compte dans les stratégies de conservation et
de gestion des hydrosystèmes face aux changements climatiques.
🎯 Objectifs du stage
Ce stage propose d’explorer cette question en s’appuyant sur une approche de modélisation
basée sur la théorie Dynamic Energy Budget (DEB), en intégrant la variabilité thermique
spatiale et temporelle. Cette approche théorique qui décrit comment les organismes
acquièrent et allouent l’énergie acquise entre différentes fonctions biologiques
fondamentales que sont la croissance, la maintenance somatique et la reproduction (Brown
et al 2004 ; Kooijman 2010). Ce travail permettra d’interroger si la variabilité a des impacts
différents en fonction du niveau d’organisation et constituera le socle théorique pour cadrer
les futures expérimentations d’une thèse de doctorat.
🔬 Missions concrètes
1. Développement théorique :
Intégration de la stochasticité thermique dans les modèles DEB existants
Exploration des liens mécanistiques entre contraintes physiologiques et performance
écologique
Modélisation des impacts différentiels selon les niveaux d’organisation biologique
2. Mise en lien avec les données existantes :
Analyse des refuges thermiques d’été : évaluation de l’utilisation des habitats froids
par Thymallus thymallus (ombre commun) dans la rivière Ain
Étude des refuges thermiques d’hiver : analyse des concentrations massives de
cyprinidés (Alburnus alburnus, Rutilus rutilus, Squalius cephalus) dans la rivière
Buèges
Compétences développées
Modélisation (DEB, R/Python)
Analyse de données de terrain
Écologie thermique des poissons d’eau douce
Approche multi-échelles (physiologie → écologie)
Préparation de projets de recherche expérimentaux
Profil recherché
M2 en écologie, mathématique
Une première expérience en modélisation écologique serait un atout
Références
Brown, J. H., Gillooly, J. F., Allen, A. P., Savage, V. M., & West, G. B. (2004). TOWARD A METABOLIC THEORY OF ECOLOGY.
Ecology, 85(7), 1771–1789. https://doi.org/10.1890/03-9000
Burggren, W. W. (2019). Inadequacy of typical physiological experimental protocols for investigating consequences of
stochastic weather events emerging from global warming. American Journal of Physiology-Regulatory, Integrative and
Comparative Physiology, 316(4), R318–R322. https://doi.org/10.1152/ajpregu.00307.2018
Easterling, D. R., Meehl, G. A., Parmesan, C., Changnon, S. A., Karl, T. R., & Mearns, L. O. (2000). Climate Extremes:
Observations, Modeling, and Impacts. Science, 289(5487), 2068–2074. https://doi.org/10.1126/science.289.5487.2068
Kooijman, S. A. L. M. (2010). Dynamic Energy Budget Theory for Metabolic Organisation. Cambridge University Press.
Slein, M. A., Bernhardt, J. R., O’Connor, M. I., & Fey, S. B. (2023). Effects of thermal fluctuations on biological processes: A
meta-analysis of experiments manipulating thermal variability. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences,
290(1992), 20222225. https://doi.org/10.1098/rspb.2022.2225
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