Ingénieur.e « Indicateurs de tendances temporelles des populations – Vigie-Nature »

Le MNHN recrute :
Ingénieur.e « Indicateurs de tendances temporelles des populations – Vigie-Nature »

CONTEXTE
La production d‘indicateurs comme outils de suivi de l’état de la biodiversité et de ses changements spatiotemporels est un enjeu majeur pour pouvoir mieux informer les citoyens ainsi que concevoir, alimenter et évaluer les politiques publiques de conservation.

Le Centre d’écologie et des sciences de la conservation (CESCO), laboratoire du Muséum national d’Histoire naturelle, est un acteur majeur de la production d’indicateurs de biodiversité et en particulier à partir de données issues de programmes de sciences participatives. Ces programmes s’appuient sur des réseaux de volontaires pour récolter des données standardisées de présence et d’abondance de divers groupes animaux et végétaux à l’échelle du territoire français. Ces protocoles de suivi de la biodiversité sont regroupés au sein de Vigie-Nature, le programme de science participative co-porté par l’UMR CESCO et l’UAR PatriNat (OFB-MNHN) (www.vigienature.fr).

Sur la base des données du Suivi temporel des oiseaux communs (Stoc), l’équipe Vigie-Nature a développé une méthodologie d’analyse permettant de produire des indicateurs de biodiversité : changement de l’abondance des communautés d’oiseaux spécialistes, de l’indice trophique des communautés, de l’indice thermique des communautés. La publication de l’indicateur Oiseaux communs en 2018 a eu un écho médiatique considérable, montrant l’intérêt sociétal et politique de ces outils. Aujourd’hui, plusieurs observatoires de Vigie-Nature cumulent plus de 10 ans de données, et certains alimentent l’Observatoire National de la Biodiversité (ONB). Ce recul permet d’envisager de calculer des indicateurs de variations temporelles sur d’autres taxons que les oiseaux.

Le Suivi Temporel des Rhopalocères de France (Sterf), initié en 2005 et intégré au réseau européen eBMS depuis 2021 participe au calcul du Grassland Butterfly Index (GBI) pour le compte de l’Union Européenne. A l’échelle nationale, il offre aujourd’hui un recul suffisant pour que ses données soient intégrées à la routine d’analyse issue du Stoc, afin de produire des tendances de populations par espèces. Néanmoins, les spécificités des données du Sterf et du calcul du GBI impliquent un travail préliminaire de modélisation via l’estimation des phénologies de vol des papillons (Schmucki et al. 2016). Ce projet vise donc à développer une routine de calcul permettant de (i) modéliser les phénologies de vol des papillons ; (ii) obtenir des valeurs estimées de l’abondance annuelle pour chaque site suivi et (iii) mobiliser ces données d’abondance estimées par site et par année pour calculer les indicateurs de tendances annuelles des espèces suivies au niveau national. Cette approche méthodologique pourra être déclinée pour d’autres observatoires de Vigie-Nature et en particulier le Suivi temporel des libellules (Steli).

DESCRIPTION DES MISSIONS

1. Développer un outil de calcul des tendances temporelles des papillons de jour à partir des données du Sterf, sur la base de la routine de calcul STOC. Cela doit notamment passer par le développement d’une routine d’analyses pérenne (scripts R) visant à estimer la phénologie des espèces de Rhopalocères – documenter cet outil (script annoté, readme);
2. Produire les indicateurs nationaux type GBI à partir des tendances calculées, et proposer des déclinaisons régionales de ces indicateurs (si les données le permettent).
3. Décliner la méthodologie pour d’autres observatoires de Vigie-Nature dont le Suivi temporel des libellules (Steli)
4. Produire des restitutions des résultats et participer aux réflexions sur les modalités de diffusion de ces indicateurs aux différentes parties prenantes : institutions (dont ONB), partenaires et participant.e.s, scientifiques. Contribuer à la mise à disposition des données et documentation des méta-données.

Partenaires internes :
– UMR 7204 CESCO, Equipe Vigie-Nature (20 personnes dont ingénieurs en charges de la gestion des données, des analyses et des restitutions mais aussi en charge de la médiation et de la diffusion, implication dans les groupes de travail du laboratoire), chercheur.e.s du CESCO travaillant avec les données issues des observatoires
– Unité de service PatriNat (plusieurs équipes, notamment celles en chargent du programme de surveillance terrestre de la Biodiversité, de gestions des données (e.g. SINP)

Partenaires externes : Co-porteurs des observatoires Vigie-Nature et en particulier l’Office pour les insectes et leur environnement (Opie) pour le Sterf et Steli, chercheurs en charge du développement d’indicateurs européens sur les papillons (e.g. Grassland Butterfly Index, UK CEH), Réserves Naturelles de France.

QUALIFICATIONS REQUISES
Formation initiale : Titulaire d’un BAC+5 (Master 2 ou école d’ingénieur) minimum avec un cursus en écologie / sciences de la vie / agronomie avec une forte composante en analyses de données OU un cursus en statistiques appliquées avec un intérêt pour les questions de biodiversité/écologie.

Connaissances :
• Très bonne maitrise des méthodes statistiques fréquentistes classiques (modèle linéaire, GLM, effets aléatoires, GAM)
• Programmation sur R avancée (gestion de données, visualisation, définition de fonction, GIS, annotation de scripts)
• Maitrise des outils de versionnage et de travail collaboratif (Git)
• Connaissance des standards de données naturalistes et de recherche (e.g. SINP)

Savoir-être professionnel :
• Capacités de communication, de présentation écrite et orale et de synthèse
• Sens de l’écoute, du dialogue et du consensus
• Travail en équipe n’excluant pas l’autonomie et l’esprit d’initiative
• Sociabilité, disponibilité et mobilité

MODALITÉS DE RECRUTEMENT
Temps de travail : 35h35 par semaine et 44 jours de congés annuels.
Durée : 18 mois
Rémunération : en fonction du profil du candidat retenu et des grilles de rémunération de l’établissement
Date de prise de fonction : à partir du 1er juillet 2026
Lieu : Muséum National d’Histoire Naturelle (MNHN), Centre d’écologie et des sciences de la Conservation (CESCO), Campus Buffon (Jardin des Plantes), 43 rue Buffon 75005 Paris
Conditions de travail spécifique : Horaire spécifique aux activités de recherche, participation aux tâches communes du laboratoire attendue. Exceptionnellement, travail en soirée ou le week-end pour événements.

LES AVANTAGES
Remboursement de 75% des frais de transport en commun ou forfait mobilité durable (vélo ou covoiturage)
Télétravail possible jusqu’à deux jours par semaine en fonction du cycle de travail
Offre de restauration d’entreprise
Couverture mutuelle d’entreprise
Un comité social et une association sportive et culturelle
Accès illimité aux sites de l’établissement avec invités

PROCÉDURE DE RECRUTEMENT
Le dossier de candidature est à déposer avant le 21 mai 2026 sur la plateforme de recrutement du Muséum uniquement à cette adresse : https://recrutement.mnhn.fr/front-jobs-detail.html?id_job=1524&id_origin=0

Le dossier de recrutement comprendra :
– un curriculum vitae ;
– une lettre de motivation ;
– deux contacts référents (peuvent être inclus dans le CV)