Contexte
Face à la perte et fragmentation des habitats naturels qui menacent la biodiversité [1], la loi européenne sur la restauration de la nature, vise à restaurer 20 % de la superficie terrestre. Cela implique un besoin urgent d’une planification de la restauration efficace. Or les efforts de restauration actuels s’avèrent insuffisants [2,3], car ils se concentrent sur des objectifs basés sur la superficie et s’appuient sur une planification cartographique incertaine [4]. Cela se traduit par un retour sur investissement incertain, une faible priorité politique et un engagement insuffisant des parties prenantes [5]. L’absence d’outils permettant d’évaluer le potentiel biologique des scénarios de restauration avant leur mise en œuvre constitue un obstacle majeur à l’optimisation de l’allocation des ressources et à la rupture de ces boucles de rétroaction négatives. Le projet ERC BioValidR (2026-2027) entend s’attaquer à cette question. C’est dans ce cadre que se situe ce projet de stage, en partenariat avec le territoire de Plaine Commune Grand Paris.
Objectifs
Ce stage vise à aborder la question de l’effectivité biologique d’action de renaturation en ville par une approche expérimentale en microcosmes (i.e. conditions contrôlées en laboratoire) en se focalisant sur le modèle d’étude Folsomia Candida (i.e. un microarthropode du sol) [6-8]. Notre équipe a en effet mis au point ces dernières années un nouveau type d’expérimentations spatialement explicites [9,10].
Les objectifs du stage seront de :
1) Mener une expérimentation en microcosmes comparant différents scénarios de renaturation pour la zone d’étude sélectionnée
2) Evaluer les dynamiques de population de F. Candida en réponse à ces scénarios
3) Synthétiser les résultats et leur apport quant à la réflexion sur un aménagement concret de la zone d’étude
L’étudiant.e participera au montage et mènera une expérimentation en mini-paysages au laboratoire. Il/elle effectuera le suivi des microcosmes au fil du temps par photographie [11], et il/elle en analysera les résultats avec des approches statistiques sous R (modèles mixtes). Il/elle participera à l’analyse critique sur ce type d’expérimentations en tant que support de réflexion pour les aménageurs à travers des réunions régulières avec le territoire de Plaine Commune.
1. IPBES. Global Assessment Report on Biodiversity and Ecosystem Services. (2019).
2. Secretariat of the Convention on Biological Diversity (2020) Global Biodiversity Outlook 5. Montreal,
https://www.cbd.int/gbo/gbo5/publication/gbo-5-en.pdf
3. Atkinson J, et al., (2022) Terrestrial ecosystem restoration increases biodiversity and reduces its
variability, but not to reference levels: A global meta-analysis. Ecol Lett. 25(7):1725-1737
4. Maxwell SL, et al., (2020) Area-based conservation in the twenty-first century. Nature 586, 217–227
5. Cortina-Segarra J, et al., (2021) Barriers to ecological restoration in Europe: expert perspectives,
Restoration Ecology 29(4): e13346
6. Rantalainen, M.-L., Haimi, J., Fritze, H., Pennanen, T. & Setälä, H. Soil decomposer community as a model system in studying the effects of habitat fragmentation and habitat corridors. Soil Biol. Biochem. 40, 853–863 (2008).
7. Gilarranz, L. J., Rayfield, B., Liñán-Cembrano, G., Bascompte, J. & Gonzalez, A. Effects of network modularity on the spread of perturbation impact in experimental metapopulations. Science (80-. ). 357, 199–201 (2017).
8. Santonja, M., Aupic-Samain, A., Forey, E. & Chauvat, M. Increasing temperature and decreasing specific leaf area amplify centipede predation impact on Collembola. Eur. J. Soil Biol. 89, 9–13 (2018).
9. Argote, K., Geslin, B., Hernandez-Possémé, L. et al. Beyond network-based approaches: uncovering the true cost of connectivity. Landsc Ecol 41, 136 (2026). https://doi.org/10.1007/s10980-026-02382-3
10. Argote, K., Geslin, B., Santonja, M. and Albert, C.H. (2026), The amount of reachable habitat determines population fate. Ecography, 2026: e08080. https://doi.org/10.1002/ecog.08080
11. Mallard, F., Le Bourlot, V. & Tully, T. An automated image analysis system to measure and count organisms in laboratory microcosms. PLoS One 8, e64387 (2013).
Ce stage permettra à l’étudiant de se confronter
– à la mise en place d’une expérimentation en laboratoire
– de faire le suivi d’une expérimentation, observations, prise de données
– de gérer et d’analyser des données
– de travailler dans une équipe déjà soudée et dynamique
– de découvrir le monde de la recherche avec un projet complet du design à l’analyse
– d’interagir avec des gestionnaires de territoire
Encadrement:
• Cécile ALBERT (DR CNRS), cecile.albert@imbe.fr
• Mathieu SANTONJA (MC AMU), mathieu.santonja@imbe.fr
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