Résumé synthétique
Ce stage de M2 en écologie vise à analyser un suivi floristique de long terme dans une tourbière active (Frasne-Bouverans, Doubs, France). À partir de données de végétation collectées entre 2004 et 2022, l’étudiant·e analysera l’évolution des communautés végétales face au changement climatique dans l’environnement R.
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(English speakers are also welcome! For full English description, please contact us.)
This M2 internship in ecology aims to analyze long-term floristic data in an active peat bog (Frasne-Bouverans, Doubs, France). Using vegetation data collected between 2004 and 2022, the student will analyze the evolution of plant communities in the face of climate change in R environment.
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Contexte général
Les tourbières, zones humides à haute valeur patrimoniale, occupent seulement 2,8 % de la surface terrestre (Xu et al., 2018) mais stockent environ 25 % du carbone mondial des sols, soit plus que l’ensemble des forêts mondiales (Austin et al., 2025; Loisel et al., 2021). Ce rôle de puits de carbone repose sur une accumulation très lente de tourbe, de l’ordre de 1 à quelques mm/an (Charman, 2002; Stivrins et al., 2017). Or, la majorité des tourbières européennes, jusqu’à 80 % pour certains pays, ont subi des dégradations (Bonn et al., 2016; Keane et al., 2025).
Le fonctionnement des tourbières repose notamment sur : (I) des communautés végétales spécialisées dont la vulnérabilité aux changements globaux reste mal comprise (Dieleman et al., 2015; Laine et al., 2021) ; (II) un ensemble de paramètres abiotiques (e.g., niveau de nappe, ensoleillement, régime pluviométrique), dont l’augmentation de la variabilité peut fortement perturber la biocénose qu’elles hébergent.
Contexte du stage
La tourbière active de Frasne (Doubs) se situe dans la réserve naturelle régionale des tourbières de Frasne-Bouverans. La tourbière fait l’objet d’un suivi floristique de long terme conduit par le Conservatoire botanique national de Franche-Comté (CBNFC-ORI, Bailly & Greffier, 2022). Le site héberge également de nombreuses espèces patrimoniales à l’échelle nationale.
Toutes les données qui seront analysées dans le cadre du stage ont déjà été collectées. Elles comprennent une série de relevés diachroniques de végétation sur une période de 18 ans, avec 4 campagnes (2004, 2010, 2017, 2022) sur 16 placettes permanentes (2 m x 2 m), dans la tourbière de Frasne. Les relevés de végétation (bryophytiques et vasculaires) ont été réalisés selon la méthodologie de Braun-Blanquet.
En complément, l’étudiant·e disposera d’un jeu de données parallèle collecté sur le même complexe tourbeux, mais selon un design expérimental croisant réchauffement simulé (OTC) et gradient hydrologique. Ces données, déjà analysées dans le cadre d’une publication en cours de rédaction, permettront de confronter les trajectoires naturelles et expérimentales de la végétation de tourbière.
Objectifs du stage
– Analyser l’évolution floristique des placettes suivies entre 2004 et 2022
– Décrire les trajectoires successionnelles et leur éventuelle stabilisation
– Identifier les principaux facteurs environnementaux associés à ces dynamiques dans le contexte du changement climatique (e.g., évolution des températures et des précipitations)
– Comparer ces trajectoires naturelles à celles issues du dispositif expérimental adjacent
Valorisation et perspectives
– Présentation d’un poster scientifique au Forum des Jeunes Chercheurs par l’étudiant·e
– Possible valorisation des résultats dans une publication à laquelle sera associé·e l’étudiant·e
Profil recherché
Nous recherchons un·e étudiant·e de niveau M2 en écologie (ou domaine proche) avec un intérêt pour l’écologie des tourbières et/ou de la végétation. Les compétences suivantes sont attendues :
– Analyses multivariées (ACP, RDA, CCA…)
– Bon niveau en R (manipulations, visualisations et analyses)
– Autonomie et rigueur
– Bonnes capacités rédactionnelles et orales
– Des connaissances en écologie fonctionnelle sont un plus
Aspects pratiques
– Encadrants : Heikel BALTI, Arnaud MOULY
– Laboratoire d’accueil : UMR 6249, Chrono-environnement, Université Marie et Louis Pasteur, 25000 Besançon, France
– Durée du stage : 5/6 mois
– Période du stage : début entre janvier et février 2026
– Gratification : indemnités de stage réglementaires
Envoyer CV et lettre de motivation à
📧 heikel.balti@univ-fcomte.fr
Objet : « Candidature stage M2 (2026) »
Date limite de candidature : 15/12/2025
Références
Austin, K., Elsen, P., Honorio Coronado, E., DeGemmis, A., Gallego-Sala, A., Harris, L., Kretser, H., Melton, J., Murdiyarso, D., Sasmito, S., Swails, E., Wijaya, A., Winton, R., & Zarin, D. (2025). Mismatch Between Global Importance of Peatlands and the Extent of Their Protection. Conservation Letters, 18. https://doi.org/10.1111/conl.13080
Bailly, G., & Greffier, B. (2022). Suivi floristique de la tourbière vivante de Frasne. Quatrième passage, 28-29 juin 2022. Conservatoire botanique national de Franche-Comté.
Bonn, A., Allott, T., Evans, M., Joosten, H., & Stoneman, R. (Eds.). (2016). Peatland Restoration and Ecosystem Services: Science, Policy and Practice. Cambridge University Press. https://doi.org/10.1017/CBO9781139177788
Charman, D. (2002). Peatlands and environmental change. https://www.cabidigitallibrary.org/doi/full/10.5555/20023090783
Dieleman, C. M., Branfireun, B. A., McLaughlin, J. W., & Lindo, Z. (2015). Climate change drives a shift in peatland ecosystem plant community: Implications for ecosystem function and stability. Global Change Biology, 21(1), 388–395. https://doi.org/10.1111/gcb.12643
Keane, B., Shuttleworth, E. L., Evans, M. G., Ritson, J. P., Harris, A., Johnston, A., Alderson, D. M., & Clay, G. D. (2025). Recovery of Sphagnum from drought is controlled by species-specific moisture thresholds. Scientific Reports, 15(1), 22167. https://doi.org/10.1038/s41598-025-05348-8
Laine, A. M., Korrensalo, A., Kokkonen, N. A. K., & Tuittila, E.-S. (2021). Impact of long-term water level drawdown on functional plant trait composition of northern peatlands. Functional Ecology, 35(10), 2342–2357. https://doi.org/10.1111/1365-2435.13883
Loisel, J., Gallego-Sala, A. V., Amesbury, M. J., Magnan, G., Anshari, G., Beilman, D. W., Benavides, J. C., Blewett, J., Camill, P., & Charman, D. J. (2021). Expert assessment of future vulnerability of the global peatland carbon sink. Nature Climate Change, 11(1), 70–77.
Stivrins, N., Ozoloa, I., Galka, M., Kuske, E., Alliksaar, T., Andersen, T. J., Lamentowicz, M., Wulf, S., & Reitalu, T. (2017). Drivers of peat accumulation rate in a raised bog: Impact of drainage, climate, and local vegetation composition. Mires and Peat, 19(8). https://doi.org/10.19189/MaP.2016.OMB.262
Xu, J., Morris, P. J., Liu, J., & Holden, J. (2018). PEATMAP: Refining estimates of global peatland distribution based on a meta-analysis. Catena, 160, 134–140.
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