# Présentation du sujet de stage
La sole commune (Solea solea) du golfe de Gascogne constitue une espèce d’importance majeure pour les pêcheries de la région, certaines flottilles françaises dépendant très fortement de cette ressource.
Le stock de sole commune du Golfe de Gascogne fait l’objet d’une évaluation annuelle par le Working Group for the Bay of Biscay and the Iberian Waters Ecoregion (WGBIE ; ICES 2026) du Conseil International pour l’Exploration de la Mer (CIEM) afin de produire des avis scientifiques sur les possibilités de pêche. Depuis 2024, cette évaluation repose sur un modèle à espace d’états (SAM), suite à un benchmark ayant permis la mise à jour du modèle et l’intégration de nouvelles données. Les évaluations les plus récentes révèlent toutefois une diminution continue de la biomasse féconde et du recrutement à l’âge 2 depuis 2009, marquée par une chute particulièrement marquée en 2019. Ces diminutions de biomasse et de recrutement ont eu pour conséquence une baisse importante des quotas depuis 2022. Bien que les mesures de gestion associées aient permis de ramener la mortalité par pêche au niveau du rendement maximal durable, la biomasse et le recrutement à l’âge 2 continuent de décliner, ce qui suggère que cette tendance résulte davantage d’une baisse de productivité de la population affectant son recrutement que de la seule pression
de pêche.
Ce stage vise à explorer de nouvelles configurations du modèle d’évaluation utilisé par le WGBIE, en intégrant notamment les compartiments juvéniles (âges 0 et 1) à partir des données de captures commerciales et des indices d’abondance issus des campagnes scientifiques halieutiques.
L’intégration de ces nouvelles données devrait permettre de mieux anticiper les recrutements à venir et, ainsi, de proposer des mesures de gestion plus adaptées à la situation du stock. D’autres pistes d’amélioration du modèle actuel seront également explorées, en particulier concernant les
choix de modélisation des processus latents.
Le traitement des données et la partie modélisation seront réalisés sous R. GitLab sera utilisé afin de partager et suivre le développement des scripts R.
Si le calendrier le permet, une présentation des premiers résultats du stage sera réalisée lors de la réunion annuelle du groupe de travail WGBIE au mois de mai (participation en anglais).
La réalisation de ce stage nécessite une culture et un intérêt marqué vis-à-vis de l’halieutique et de l’écologie marine. Les approches de modélisation hiérarchique et de dynamique de population constituent toutefois les aptitudes les plus importantes à mettre en œuvre par le (la) candidat(e)
retenu(e).

# Références
Anders Nielsen, Casper W. Berg (2014). Estimation of time-varying selectivity in stock assessments
using state-space models. Fisheries Research 158, 96-101.
Casper W. Berg, Anders Nielsen (2016). Accounting for correlated observations in an age-based state-
space stock assessment model. ICES Journal of Marine Science 73, 1788-1797.
ICES (2026). Working Group for the Bay of Biscay and Iberian Waters Ecoregion (WGBIE) 2026 Report.
ICES Scientific Reports. Report. https://doi.org/10.17895/ices.pub.32790321.v1

# Niveau d’étude
Master 2 en écologie quantitative ou halieutique

# Durée et Localisation
Vous serez accueillis 6 mois, à partir de janvier ou février 2027, dans les locaux d’Ifremer à Nantes, laboratoire d’Ecologie et Modèles pour l’Halieutique (EMH). Une indemnité de stage sera attribuée, conformément au montant minimum légal.

# Encadrants
Jean-Baptiste Lecomte (UMR DECOD, Ifremer Nantes) jean.baptiste.lecomte@ifremer.fr
Youen Vermard (UMR DECOD, Ifremer Nantes) youen.vermard@ifremer.fr

# Modalité de candidature
Les candidatures se composeront d’un CV et d’une lettre de motivation à adresser aux 2 encadrants. Le processus de sélection s’effectuera en continu, jusqu’à pourvoir le stage.

Le contenu de cette offre est la responsabilité de ses auteurs. Pour toute question relative à cette offre en particulier (date, lieu, mode de candidature, etc.), merci de les contacter directement. Un email de contact est disponible: jean.baptiste.lecomte@ifremer.fr

Pour toute autre question, vous pouvez contacter sfecodiff@sfecologie.org.