Contexte du stage :
Le Museum National d’Histoire Naturelle (MNHN), en partenariat avec la Ligue pour la Protection des Oiseaux (LPO France) et l’Office Français de la Biodiversité (OFB), coordonne le “Suivi Temporel des Oiseaux Communs – Echantillonnages Ponctuels Simples” (STOC-EPS), consacré à l’étude approfondie de l’état de conservation des oiseaux communs en France. À travers ce suivi, plus de 2000 ornithologues bénévoles et professionnels, présents sur tout le territoire, recensent l’avifaune française selon un protocole répété chaque année. Depuis sa création en 1989, des dizaines de millions de données ont été collectées, permettant d’analyser l’évolution spatiale et temporelle des 123 espèces d’oiseaux les plus répandues en France. A l’heure actuelle ces tendances sont calculées à l’échelle nationale pour chacune des espèces et pour tous les habitats confondus. En parallèle, le MNHN produit également des indicateurs par groupe de spécialisation (oiseaux généralistes, spécialistes agricoles, urbains et forestiers), utilisés comme baromètre de la biodiversité pour orienter les politiques publiques, en se basant principalement sur l’écologie des espèces (traits d’histoire de vie).
Dans le cadre de ce stage, le MNHN et la LPO souhaitent affiner une approche par habitat, en s’intéressant en particulier aux données collectées en milieu forestier. L’idée est de comprendre ce qui se cache derrière ce chiffre unique de “tendance des oiseaux spécialistes
forestiers”. Comment cette tendance varie-t-elle lorsqu’on restreint les relevés aux milieux forestiers puis que l’on prend en compte différentes variables comme la composition et la structure forestière, les différents zonages de protection ou le statut foncier des parcelles forestières ?
Au plus près de l’équipe Vigie Nature, ce stage sera effectué au sein du Centre d’Ecologie et des Sciences de la Conservation (CESCO, au MNHN, Paris), en étroite collaboration avec le Service Connaissance de la LPO France (Rochefort) et Frédéric Gosselin de l’INRAE (Nogent-
sur-Vernisson).
Objectifs du stage :
L’objectif général du stage est de développer et évaluer un nouvel indicateur “oiseaux forestiers” à partir des données STOC EPS. Dans un premier temps, il s’agira d’identifier les points STOC réalisés en milieu forestier à partir de la cartographie des zones forestières. Les tendances démographiques pour chaque espèce seront ensuite estimées à l’échelle intra-forestière, et comparées à leur tendance générale à l’échelle multi-habitats. A partir de ces résultats, un nouvel indicateur forestier sera calculé, et confronté à l’indicateur “spécialistes forestiers”, utilisé actuellement par le MNHN. Une attention particulière sera portée aux espèces fournissant peu de données, notamment à l’échelle régionale, et aux conséquences de leur inclusion (ou non) dans le calcul de l’indicateur.
Dans un second temps, d’éventuelles différences dans les tendances démographiques des espèces seront estimées en fonction de variables forestières comme la composition et la diversité forestières, la biogéographie ou encore le statut foncier des parcelles forestières (forêts domaniales, communales ou privées). Suivant les intérêts du ou de la candidat.e, d’autres variables explicatives liées à l’écologie des espèces d’oiseaux pourront être étudiées, comme les stratégies de migration (sédentaire versus migrateur, migrateurs intra-européens versus migrateurs transsahariens) ou les stratégies de reproduction (cavernicole, nicheur au sol, etc).
Profil recherché :
• Formation : Étudiant.e en Master 2 en Ecologie et/ou Biostatistiques
• Compétences en analyse de données :
o Compétences en analyses statistiques (modèles linéaire et généralisé, modèle mixte)
o Maitrise du logiciel R (expérience en programmation, utilisation de gros jeux de données)
o Compétences en cartographie et analyses spatiales (Système Information Géographique, SIG)
o Connaissance des bases de données relationnelles
• Connaissances en ornithologie (souhaitable) : connaissance des oiseaux européens, en particulier les espèces forestières.
• Compétences scientifiques en écologie : capacité à organiser le raisonnement et les analyses autour d’hypothèses reliées à l’état de l’art.
• Compétences rédactionnelles, et esprit de synthèse.
• Rigueur et organisation.
• Dynamisme et esprit d’équipe.
Pour candidater :
Envoyer un CV et une lettre de motivation par email avec en objet « candidature stage forêt à suzanne.bonamour@lpo.fr et benoit.fontaine@mnhn.fr avant le 04/11/2024.
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