Description de l’offre
Sujet de thèse : Caractérisation de la biocolonisation de structures artificielles dans le cadre du developpement de l’eolien en MER : approches méthodologiques et ingénierie ecologique
La thèse s’inscrit dans le contexte du projet QUANTUM (2026-2029) qui aborde d’importantes problématiques liées à la biocolonisation des structures artificielles, tant d’un point de vue ingénierie qu’environnemental.
La thèse s’articule autour de trois axes :
Exploitation de l’imagerie sous-marine: Développer et optimiser une méthode d’analyse d’images pour le suivi de la biocolonisation et l’appliquer aux jeux de données existants
Méthode de suivi: Comparer différents protocoles de suivi de la biocolonisation (g. prélèvements et imagerie par plongeurs et ROV, imagerie sous-marine, ADN environnemental) afin d’identifier leurs performances, limites et complémentarités ;
Ingénierie écologique: Évaluer l’efficacité écologique de dispositifs d’ingénierie écologique sur la biocolonisation.
Missions
Les missions attendues sont :
S’imprégner de la littérature actuelle dans le domaine de l’analyse d’images sous-marines et proposer et tester des protocoles d’annotation d’images sous-marines optimisés sur la base d’une banque d’images sous-marines déjà acquise mise à disposition par des partenaires du projet ;
Extraire les données biologiques de ces banques d’images sous-marines afin d’étudier et analyser les patterns de biocolonisation sur de larges échelles spatio-temporelles (par ex pour identifier ses spécificités sur différentes provinces biogéographiques) ;
Organiser, préparer et participer à des campagnes de terrain en mer afin de déployer différentes méthodes de suivi de la biocolonisation sur deux sites d’étude : la structure de protection du câble d’export d’un parc éolien en mer en Atlantique ainsi que le mât de mesure du parc éolien de Fécamp en Normandie ;
Dépouiller les échantillons obtenus lors des différentes campagnes de terrain e.g. détermination de la macrofaune benthique, analyse d’images, préparation d’échantillons pour séquençage de l’ADN ;
Analyser statistiquement et comparer les données de biodiversité obtenues avec les différentes méthodes de suivis ;
Organiser, préparer et participer à des campagnes de terrain en mer biannuelle pour étudier la biocolonisation de structures artificielles éco-conçues et non-éco-conçues déployées in-situ ;
Mesurer des flux d’oxygène et de carbone (CO₂ et carbone organique) afin de caractériser le métabolisme des communautés associées à des structures artificielles éco-conçues ;
Analyser et interpréter statistiquement les patterns de succession écologique de la biocolonisation ;
Restituer les résultats obtenus à des conférences internationales et les valoriser sous-forme d’articles scientifiques.
Le travail de thèse s’effectuera entre France Energies Marines, IFREMER et l’Université de Caen.
Compétences requises
Formation initiale
Master 2 en écologie marine / biologie marine ou équivalent d’école d’ingénieurs.
Connaissances spécifiques
Connaissance des écosystèmes marins et plus particulièrement benthiques
Compétences en exploitation de données et analyses statistiques sur R
Compétences en gestion et manipulation de bases de données
Intérêt pour les enjeux environnementaux et les énergies marines renouvelables
Expérience professionnelle
Une première expérience en analyse d’image
Qualités professionnelles
Appétence pour le travail de terrain
Esprit d’initiative
Esprit d’équipe
Capacité rédactionnelle
Maîtrise de l’anglais écrit et oral
Les + :
Un attrait pour les outils informatiques de traitement d’images
Une bonne capacité au travail en mer
Un intérêt pour la science appliquée
Prise de poste : 16/11/2026
Date limite de candidature : Le 10/08/2026
Pour candidater, rendez-vous sur le site web de France Energies Marines à la rubrique Nous
rejoindre.
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