Contexte
Ce stage s’inscrit dans le projet LATITUDE soutenu par la MITI du CNRS dont l’objectif est d’initier un suivi à long terme de l’impact des changements globaux sur les oiseaux le long du gradient latitudinal du Canada par un suivi par acoustique passive.
En 2024, un réseau sur 12 stations avec deux capteurs acoustiques SM4 sur chacune d’entre elles a été déployé le long d’un gradient latitudinal de 3000 km du subarctique au haut-arctique.
Les données acoustiques récoltées devront répondre à 4 questions :
(1) Quels sont les réassemblages de communautés d’oiseaux ?
(2) Quels sont les changements de dates d’arrivées des oiseaux sur les sites de nidification ?
(3) Y a-t-il un changement de la phénologie de chant et
(4) des rythmes circadiens d’activité vocale des oiseaux sur le long terme ?
Objectifs du stage
Il existe de nombreuses méthodes automatisées pour extraire rapidement des variables écologiques de données audios. L’objectif du stage est de comprendre (1) quelles sont les plus pertinentes par rapport aux questions posées dans le cadre du projet LATITUDE (2) quelles sont les plus valides par rapport à des données issues d’écoutes/annotations manuelles.
L’objectif du stage est donc d’identifier les variables à extraire des données audios pour documenter l’impact des changements globaux sur les oiseaux à long terme et plus particulièrement :
(1) Variables espèces-centrées
– Quelle est la validité des identifications automatisées fournies par BirdNET par rapport à des écoutes/annotations manuelles ?
– Quelles variables extraire des données espèces pour documenter : la structure des communautés, le jour d’arrivée sur le site de nidification des espèces, la durée saisonnière de l’activité vocale, le rythme circadien d’activité vocale ?
(2) Variables bioacoustiques
– Quels indices bioacoustiques sont les plus pertinents pour documenter la composition de la communauté d’oiseaux et les dates d’arrivées des migrateurs par rapport à des données issues d’identifications automatisées ou des données issues d’écoutes/annotations manuelle ?
Déroulement du stage et tâches confiées au stagiaire
L’étudiant(e) travaillera sur des données acoustiques déjà récoltées sur 4 stations du Nunavik en 2023 et 2024 (Kuujjuarapik, Umiujaq, Lac à l’Eau Claire, Salluit).
Les principales tâches confiées à l’étudiant(e) seront :
– Ecoute / Annotation des fichiers audios pour identification des espèces présentes
– Comparaison des résultats obtenus avec les identifications automatisées de BirdNET
– Comparaison des résultats obtenus avec les indices bioacoustiques
– Sélection de variables pertinentes pour un suivi à long terme des communautés d’oiseaux le long du gradient nordique face aux changements globaux
Compétences et profil recherché
– Master 1 ou 2 en écologie / biologie / géographie
– Bonnes capacités d’identification aux cris et aux chants des oiseaux du subarctique et de l’arctique canadien
– Une connaissance du logiciel R serait la bienvenue
– Connaissances élémentaires en statistiques
– Autonomie, esprit d’analyse et capacité à travailler en équipe
Encadrants
Laurent Godet (CNRS, Université de Nantes, France ) et Joël Bêty (UQAR, Canada).
Modalités pratiques
– Stage de 4 à 6 mois (temps ajustable) à partir de février 2025, avec accueil au laboratoire LETG-Nantes, à Nantes Université, France.
– Possibilité d’une mission de terrain d’une à deux semaines en juin/juillet 2025 au Nunavik
– Indemnités de stage selon la réglementation en 2025.
C.V. et lettre de motivation à envoyer jusqu’au 20 décembre 2024 inclus à :
laurent.godet@univ-nantes.fr
Commentaires récents