[Stage licence/césure] Biologie moléculaire – Le metabarcoding comme outil pour l’étude des relations plantes-pollinisateurs

Structure d’accueil : UMR 6553 ECOBIO 263 avenue du Général Leclerc 35042 Rennes Cedex 02 23 23 63 99

Durée : 1 mois, à partir du 28 octobre 2024

Contexte et objectifs du stage : De plus en plus d’études s’intéressent au rôle des facteurs biologiques dans l’influence des écosystèmes aquatiques sur les écosystèmes terrestres, encore largement méconnu. Le stage proposé s’inscrit dans le projet de recherche STRANGE (Ecosystem Services provided by sTReams to AdjaceNt aGricultural tErrestrial ecosystems), visant à évaluer les services écosystémiques rendus par les écosystèmes aquatiques aux environnements agricoles adjacents. Le stage porte plus particulièrement sur le service de pollinisation rendu par les insectes aquatiques. L’objectif sera d’évaluer à la fois la contribution des insectes issus des milieux aquatiques à la pollinisation, et les ressources trophiques que représente la végétation aquatique et riparienne pour les insectes pollinisateurs. Pour cela, près d’un millier d’insectes ont été collectés sur le terrain, dans l’optique d’analyser les grains de pollen accrochés à leurs corps par metabarcoding moléculaire. Ce procédé permettra de décrypter les visites rendues par les insectes en décodant l’identité des plantes à fleurs portées dans ces assemblages de pollen, ce qui informera non seulement sur la capacité de pollinisation des insectes aquatiques mais également sur la prévalence des plantes typiquement hygrophiles dans les ressources appréciées par les pollinisateurs en général.

Missions du/de la stagiaire :
• Lavage d’insectes
• Extraction ADN
• PCR
• Quantification Qubit
• Electrophorèse

Conditions de réalisation du stage : Mise à disposition du matériel de protection nécessaire. Le/la stagiaire sera basé(e) à Rennes.

Profil requis :
• Etudiant(e) en licence ou équivalent (ou césure)
• Connaissances de base en biologie moléculaire
• Aptitude à travailler de manière rigoureuse

Informations complémentaires et candidatures (CV + lettre de motivation) : par courriel auprès de Benoit Geslin, Maître de Conférence (benoit.geslin@univ-rennes1.fr), et Cassandre Murail, doctorante (cassandre.murail-zimmermann@univ-tours.fr) avant le 01/10/2024.

Références :
Bell, K. L., Fowler, J., Burgess, K. S., Dobbs, E. K., Gruenewald, D., Lawley, B., Morozumi, C., & Brosi, B. J. (2017). Applying pollen DNA metabarcoding to the study of plant–pollinator interactions. Applications in Plant Sciences, 5(6). https://doi.org/10.3732/apps.1600124
Lucas, A., Bodger, O., Brosi, B. J., Ford, C. R., Forman, D. W., Greig, C., Hegarty, M., Jones, L., Neyland, P. J., & De Vere, N. (2018). Floral resource partitioning by individuals within generalised hoverfly pollination networks revealed by DNA metabarcoding. Scientific Reports, 8(1). https://doi.org/10.1038/s41598-018-23103-0
Richard, E., Braukmann, T., Raine, N., & Steinke, D. (2024). A little-known world—Assessing a non-bee crop flower visiting community using metabarcoding. Authorea, Inc. https://doi.org/10.22541/au.171182026.67417474/v1