Les Missions
La personne recrutée aura la charge de développer un protocole de détection et de quantification de la Tordeuse des Bourgeons de l’Epinette (TBE) au cours de l’Holocène à partir d’analyses d’ADN sédimentaire lacustre (qPCR, DD-PCR). Elle utilisera ces données pour reconstituer la fréquence et/ou l’intensité des épidémies de TBE, pour caractériser les interactions avec les régimes de feux. In fine, elles serviront également dans l’approche combinée paléo-modélisation, au cœur du projet RETROPEST (https://anr.fr/Projet-ANR-24-CE02-6823).
L’Activité
• Détermination d’un gène cible pour le design d’amorces spécifiques à Choristoneura fumiferana dans l’ADN mitochondrial et/ou nucléaire
• Développement d’un protocole de qPCR et DD-PCR pour la quantification de ce gène cible dans des matrices sédimentaires (objectifs : obtenir des concentrations robustes et reproductibles)
• Application de ce protocole aux enregistrements sédimentaire lacustres du projet. Pour ce volet le candidat bénéficiera de l’appui technique des personnels du laboratoire, et pourra également encadrer un ou des étudiants de M2.
• Traitement des concentrations obtenues (ADN de Choristoneura fumiferana) pour calculer des fréquences d’épidémies
• Comparaison des données obtenues avec les données sur les feux de forêts et les dynamiques de végétation
• Publication de la méthodologie développée, et publication des résultats combinés dans une étude multi-proxies sur les perturbations multiples
Votre Profil
Compétences
– Doctorat en paléo-écologie, ADN sédimentaire ou ADN environnemental
– Connaissances des protocoles et techniques de biologie moléculaire (PCR, qPCR, etc…)
– Compétences en traitement numérique des données (R/Python/…)
– Capacité à s’intégrer dans une équipe multidisciplinaire et à participer à des projets collaboratifs.
Votre Environnement de Travail
Ce poste de chercheur post-doctoral s’inscrit dans le cadre du projet ANR RETROPEST (https://anr.fr/Projet-ANR-24-CE02-6823) « Wildfires & Insect outbreaks in Boreal forests. A combined approach using paleoecology, sedimentary DNA & modelling »(2025-2029, PI: D. Rius). L’objectif général de ce projet est de mieux caractériser les interactions entre ces deux régimes de perturbations en réponse au changement climatiques passé, présent et futur et leur impact sur les dynamiques de végétation forestière au Québec à ces mêmes échelles de temps. Le projet s’appuiera sur un réseau de sites d’études régionaux, composés de carottages courts (ca 2000 ans) et longs (ca 8000 à 9000ans, ie depuis la déglaciation, WP1), sur des quantifications paléoclimatiques des T° estivales (WP2) et des reconstructions de la végétation (pollen) et des paléofeux (charbon, WP3) au cours de l’Holocène. Les épidémies de TBE seront quant à elles reconstruites à partir de l’ADN sédimentaire dans les carottes lacustres.
La personne recrutée sera encadrée par le PI du projet et par B. Valot (IR CNRS) qui apportera son expertise en biologie moléculaire. Elle bénéficiera également de l’appui technique des personnels de UT de biologie moléculaire (A. Cardot-Laboisière) ainsi que des nouvelles installations dédiées à l’ADN ancien au laboratoire.
La personne recrutée travaillera au laboratoire Chrono-Environnement, dans le thème DYNABIO (« Dynamique de la biodiversité et trajectoires fonctionnelles des écosystèmes »), dont un des 3 axes de recherche concerne les « trajectoires spatio-temporelles des écosystèmes en réponse aux changements globaux ».
Rémunération et avantages
Rémunération
3000 € bruts mensuels à ajuster selon l’expérience
Congés et RTT annuels
44 jours
Pratique et Indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
lien vers l’annonce en anglais : https://emploi.cnrs.fr/Offres/CDD/UMR6249-SEBLAN-019/Default.aspx?lang=EN
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