Évaluation multisite et multitechnique de l’activité biologique des sols à l’échelle parcellaire
Contexte du stage
La récente Directive Européenne 2025/2360 relative à la surveillance et à la résilience des sols, adoptée en 2025, pose un cadre harmonisé à l’échelle européenne visant à surveiller, évaluer et améliorer la santé des sols, en s’appuyant sur des indicateurs bio-physico-chimiques. Malgré une émergence récente du volet biologique dans l’évaluation de la santé des sols, les indicateurs relatifs à l’activité biologique sont encore peu utilisés et les méthodes restent multiples : respiration basale des micro-organismes, inventaires de biodiversité par comptage, analyse ADN ou quantifications de biomasse, Tea Bag index, LevaBag, Bait Lamina ou Slip en coton. Ces dernières sont classiquement utilisées mais peuvent engendrer certains inconvénients : coût élevé, faible reproductibilité, manque de référentiel ou de valeurs seuils, besoin d’une solide expertise d’interprétation. D’autres méthodes sont moins communes et possèdent un fort potentiel comme les mesures in situ des flux de CO2 en chambre gaz (IRGA, LI-COR) ou bien des outils comme AVATAR-SOL ou « Cotton strip » (bandes de coton), mais ces dernières nécessitent encore du développement. Il est donc aujourd’hui nécessaire de développer, standardiser et comparer des outils permettant de caractériser et d’évaluer de manière robuste l’activité biologique des sols.
Votre mission et vos activités
Votre mission s’inscrira dans le projet BiActol : BIological ACtivity evaluation in sOiLs financé par OTELo. Ce projet mené entre les laboratoires du LIEC et du LSE a pour objectif de continuer à développer certains outils d’évaluation de la qualité biologique des sols (AVATAR-SOL, flux de CO2 en chambre à gaz, Cotton-strip) et de les comparer à des méthodes plus classiquement utilisées comme l’hydrolyse de la FDA ou la mesure d’abondance des microorganismes afin de vérifier leur fiabilité. Ces méthodes seront testées sur des sols avec un gradient d’anthropisation marqué afin de déterminer si ces méthodes sont comparables et applicables à tous les types de sol.
Le stage consistera à :
• Proposer une revue de littérature sur les différentes méthodes d’évaluation de la qualité biologique des sols ;
• Participer à une campagne de terrain sur 4 sites autour de Nancy et sur la station expérimentale du GISFI à Homécourt (https://gisfi.univ-lorraine.fr/) en mettant en place les méthodes d’évaluation de la qualité des sols sélectionnées dans le projet : AVATAR-SOL, flux de CO2 en chambre à gaz, Cotton-strip au printemps 2027 ;
• Réaliser les suivis temporels des analyses ;
• Apporter une aide pour les analyses microbiologiques (hydrolyse de la FDA et la mesure d’abondance des microorganismes) qui seront conduites en parallèle ;
• Traiter les résultats à l’aide d’analyses statistiques pour comparer les différentes méthodes et sols ;
• Contribuer significativement à la rédaction d’un article scientifique présentant les résultats obtenus.
Vous serez donc amené(e) à collaborer avec les différents membres impliqués dans le projet et intégré(e) à des équipes pluridisciplinaires.
Profil recherché :
• Étudiant.e de Master 2/ingénieur (Bac+5) en environnement, pédologie, agronomie.
• Capacités rédactionnelles et de synthèse en français et en anglais, autonomie et rigueur.
• Appétence pour le travail de terrain et en équipe.
• Aisance avec les analyses statistiques.
• Maîtrise de la suite Microsoft Office et du logiciel R.
• Intérêt manifeste pour la recherche.
Cadre de travail :
Lieu d’accueil :
➔ Site principal : Vous serez hébergé(e) à l’UMR 7360 LIEC : laboratoire interdisciplinaire des environnements continentaux sur le site du Charmois à Vandoeuvre-lès-Nancy.
➔ Sites secondaires : Vous serez également amené(e) à vous rendre au LIEC site Aiguillettes localisé à la FST à Vandoeuvre-lès-Nancy, au LIEC site Bridoux à Metz et à l’UMR 1120 LSE : Laboratoire sols et Environnements situé sur le campus de l’ENSAIA à Vandoeuvre-lès-Nancy.
Déplacements : Des déplacements à la journée accompagnés des membres des laboratoires sont à prévoir régulièrement sur les différents sites d’échantillonnage (autour de Nancy et d’Homécourt).
Durée du stage : 6 mois
Début du contrat : février à mars 2027
Rémunération : gratification de 4,50 euros/heure (barème 2026)
Supervision : Antoine Sobaga (LIEC) et Margaux Clesse (LSE)
Merci d’envoyer un CV et une lettre de motivation à antoine.sobaga@univ-lorraine.fr et margaux.clesse@univ-lorraine.fr avant le 9 octobre 2026.
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