Ingénieur(e) d’Étude en écologie/entomologie : Identification de variétés de betteraves altérant le comportement alimentaire des pucerons et la transmission virale

L’INRAE, l’Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement
L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 273 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

VOTRE MISSION ET VOS ACTIVITÉS

Vous serez accueilli(e) au sein de l’UMR SVQV, sur le Centre INRAE Grand-Est de Colmar (https://svqv.colmar.hub.inrae.fr/). SVQV est une unité de recherche rattachée à deux organismes institutionnels (INRAE et l’Université de Strasbourg). Elle offre d’excellentes infrastructures pour réaliser des expériences moléculaires et biologiques sur les plantes et les insectes, y compris des espaces dédiés à l’élevage et l’étude des pucerons vecteurs, des serres de haute performance, des laboratoires et des équipements de biologie moléculaire de pointe. Cette offre de poste s’inscrit dans le cadre du projet ANR AGIR, ayant pour objectif général d’identifier une stratégie de protection permettant de gérer durablement la jaunisse de la betterave sucrière (causée par différents virus transmis par des pucerons vecteurs) et réduire les pertes de rendement. La stratégie testée dans ce projet propose de réduire la transmission des virus, en agissant à la fois sur le comportement alimentaire et sur la capacité de colonisation des pucerons sur les betteraves. Pour cela, deux leviers agroécologiques complémentaires seront travaillés : les variétés et les plantes de service.

Les travaux menés à INRAE Colmar concerneront l’identification de variétés de betteraves altérant le comportement alimentaire des pucerons et la transmission virale. La première étape de ces travaux consistera à réaliser un screening du comportement (sélection, dispersion, alimentation) du puceron, sur un grand nombre de variétés de betteraves grâce à une méthode novatrice de vidéo-phénotypage haut-débit. Les variétés d’intérêt identifiées seront ensuite analysées par la méthode d’électro-pénétrographie (EPG) pour confirmer les résultats obtenus et étudier les mécanismes sous-jacents des altérations comportementales. Enfin, pour confirmer que l’altération du comportement alimentaire permet de limiter la transmission des virus responsables de la jaunisse, des tests de transmission virale seront mis en place.

Le projet réunit un consortium constitué de trois unités de recherche INRAE (SVQV à Colmar, IGEPP à Rennes et PSH à Avignon) ainsi que l’Institut Technique de la Betterave (ITB), coordinateur du projet. INRAE SVQV possède une plateforme d’étude des performances et comportements des pucerons sur les plantes (EPG, dispersion, transmission etc.), et a une expertise en virologie appliquée à différents pathosystèmes dont celui de la jaunisse de la betterave sucrière.

Vous serez plus particulièrement en charge :
– de l’évaluation des réponses comportementales (dispersion, alimentation) de puceron sur différentes variétés de Betteraves (vidéo-phénotypage, analyse et traitement des données) ;
– de l’évaluation du comportement alimentaire des pucerons sur des variétés sélectionnées (mise en place de l’électro-pénétrographie, analyse et traitement des données) ;
– des tests de transmission virale par puceron à partir de ces variétés ;
– des analyses sérologiques et moléculaires pour la détection des virus ;
– de la synthèse des résultats, de leur mise en forme et de leur communication (rapports, présentations…).

Vous serez placé(e) sous la direction de Quentin Chesnais, responsable du projet, et Véronique Brault, responsable d’équipe. Vous serez en interaction avec les membres du projet au sein des équipes ViVe et GMV de l’Unité d’accueil, ainsi qu’avec les autres partenaires du projet AGIR.

LE PROFIL QUE NOUS RECHERCHONS

Domaine de formation souhaité : Écologie/entomologie, agronomie.
Formation recommandée : Bac +4 à Bac +5 (e.g., diplôme d’ingénieur, Master)
Connaissances souhaitées :
– Connaissances de base en « santé des plantes » et interactions plantes-insectes ;
– Intérêt pour le développement d’outils d’analyse d’image et de données vidéo (vidéophénotypage) ;
– Maitrise des outils informatiques et statistiques (R) ;
– Des connaissances de base en programmation (Python) et en phytopathologie seraient un plus.
Expérience appréciée : jeune diplômé(e) avec 0 à 5 ans d’expérience
Aptitudes recherchées :
– Conduite d’expérimentations en conditions contrôlées au laboratoire ;
– Dynamisme, curiosité, rigueur, patience ;
– Capacités d’initiative et organisationnelles ;
– Capacités de communication ;
– Capacité à travailler en réseau et en équipe.

Unité/Lieu : UMR SVQV (INRAE, Université de Strasbourg), 28 rue de Herrlisheim 68000 COLMAR
Website: https://svqv.colmar.hub.inrae.fr/
Type de contrat : CDD
Durée du contrat : 24 mois
Date d’entrée en fonction : Avril 2024
Rémunération brute : 2136,49 € à 2412,16 € selon le niveau d’expérience

Transmettre une lettre de motivation et un CV à :
Quentin CHESNAIS et Véronique BRAULT
Par e-mail : quentin.chesnais@inrae.fr veronique.brault@inrae.fr
Date limite pour postuler : 28/02/2024

Le contenu de cette offre est la responsabilité de ses auteurs. Pour toute question relative à cette offre en particulier (date, lieu, mode de candidature, etc.), merci de les contacter directement. Un email de contact est disponible: quentin.chesnais@inrae.fr

Pour toute autre question, vous pouvez contacter sfecodiff@sfecologie.org.