L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche placé sous la double tutelle du ministère en charge de l’agriculture et du ministère en charge de la recherche. C’est un leader mondial de la recherche et de l’innovation dans les domaines de l’agriculture, de l’alimentation de l’environnement et de ‘One Health’ (www.inrae.fr ).

Ce poste de niveau Ingénieur d’études (ou diplôme équivalent ou supérieur) est à pourvoir par voie de CDD à partir du 01/05/2024.

Poste basé à : Sophia Antipolis, UMR Institut Sophia Agrobiotech (INRAE, CNRS, Université Côte d’Azur)

ENVIRONNEMENT DE TRAVAIL, MISSION ET ACTIVITÉS
Afin d’augmenter les capacités de la communauté de recherche et innovation dans le domaine du biocontrôle à caractériser en laboratoire les auxiliaires des cultures et établir les liens entre les mesures de laboratoire et les performances « terrain », des équipes de l’unité mixte de recherche Institut Sophia Agrobiotech (ISA) et la plateforme BC2GRAPE de l’unité mixte de recherche Santé et Agroécologie du Vignoble (SAVE) à Bordeaux collaborent dans le cadre du projet TrichoPhenBio financé par l’Institut Carnot Plant2Pro. Ce projet a pour but de développer un outil de phénotypage haut-débit chez les agents de biocontrôle permettant de prédire les performances « terrain », en réalisant une preuve de concept sur une espèce du genre Trichogramma, des micro-guêpes parasitoïdes très utilisées au niveau national comme international comme agent de biocontrôle. Ce projet comprendra une étape de création et d’identification génétique de lignées de trichogrammes, une étape de phénotypage en laboratoire de ces lignées à l’aide du protocole développé, et une étape de mesure des performances de ces lignées liées à la dispersion en vignoble et au parasitime sur des oeufs sentinelles de l’eudémis Lobesia botrana, un ravageur majeur de la vigne sur lequel les méthodes de biocontrôle nécessitent d’être améliorées.

Vous serez recruté.e dans le cadre de ce projet et vous serez en charge des actions suivantes :

– Mettre en place un ensemble de lignées de trichogrammes génétiquement différentes entre elles (cette action comprendra la conduite de campagnes d’échantillonnage sur le terrain ainsi que l’organisation et la réalisation de croisements entre lignées, etc.)
– Suivre le développement de marqueurs microsatellites d’espèces du genre Trichogramma et la caractérisation génétique des lignées de trichogrammes. Pour cette action, vous vous appuierez sur l’expertise déjà présente au sein de l’institut sur cette thématique et vous contribuerez à cette action en collaborant avec les personnes ressources de l’institut et en participant à l’encadrement d’un.e stagiaire qui travaillera sur le développement des marqueurs microsatellites
– Assurer le maintien en élevage des lignées créées
– Assurer les échanges avec l’UMR SAVE et notamment le transfert de connaissances du modèle Trichogramma ainsi que le transfert du matériel biologique entre les deux instituts
– Participer à la conception des expérimentations « terrain ». Des déplacements dans le Sud-Ouest de la France seront à prévoir.
– Participer, en 2025, à la mise en place d’un outil de phénotypage haut-débit de ces lignées de trichogrammes, ainsi qu’à l’effort de phénotypage de ces lignées, en collaboration avec des étudiants recrutés et avec l’ingénieure de recherche en charge de cette thématique
– Participer aux réunions de suivi quotidien du projet ainsi qu’aux réunions périodiques et aux prises de décisions stratégiques de l’équipe opérationnelle du projet.

Pour l’ensemble des actions concernant la création, le maintien et la caractérisation génétique des lignées, vous serez placé.e sous la direction de Géraldine Groussier, l’ingénieure en charge de ces actions au sein du projet. Pour vos autres missions, vous serez placé.e sous la direction de Silène Lartigue, l’ingénieure de recherche en charge de la coordination du projet. Vous interagirez également avec l’ensemble des personnes impliquées dans le projet au sein des équipes et plateformes (la plateforme BC2GRAPE et le plateau de vidéo-phénotypage de l’infrastructure scientifique collective PlantBIOs) des deux unités.

COMPETENCES ATTENDUES ET PROFIL RECHERCHÉ
– Formation : Diplôme règlementaire exigé pour le recrutement externe : Diplôme d’ingénieur, Master ou équivalent
– Corps : ingénieur d’étude ou équivalent catégorie : A
– Domaine de formation souhaité : Sciences de la vie et de l’environnement ou des sciences agricoles.
– Expérience professionnelle souhaitée : 0 à 3 ans
– Aptitudes recherchées :
– Expérience en entomologie, en élevages d’insectes
– Expérience en expérimentations sur le terrain
– Compétences en gestion de projet et capacités organisationnelles
– Capacités de communication
– Capacités de travail en réseau et en équipe
– Aptitude à la synthèse et à la rédaction
Les aptitudes suivantes seraient un plus :
– Une connaissance des techniques d’identification et caractérisation en biologie moléculaire
– Une expérience en techniques d’acquisition, d’analyses d’images et de vidéos ou en méthodes d’intelligence artificielle

MODALITES D’ACCUEIL
– Unité : Institut Sophia Agrobiotech (UMR ISA)
– Site web de l’unité : https://institut-sophia-agrobiotech.paca.hub.inrae.fr/
– Adresse d’affectation : UMR Institut Sophia Agrobiotech (INRAE, CNRS, Université Côte d’Azur), 400 route des Chappes. BP 167. 06903. Sophia Antipolis
– Centre de rattachement : PACA
– Type de contrat : CDD
– Durée du contrat : 17 mois
– Date d’entrée en fonction : 01/05/2024
– Rémunération brute mensuelle : 2136,49 € à 2412,16 € selon le niveau d’expérience

Modalités pour postuler
– Transmettre une lettre de motivation et un CV à geraldine.groussier@inrae.fr et silene.lartigue@inrae.fr
– Date limite pour postuler : 5 semaines après publication

Le contenu de cette offre est la responsabilité de ses auteurs. Pour toute question relative à cette offre en particulier (date, lieu, mode de candidature, etc.), merci de les contacter directement. Un email de contact est disponible: silene.lartigue@inrae.fr ; geraldine.groussier@inrae.fr

Pour toute autre question, vous pouvez contacter sfecodiff@sfecologie.org.