Ingénieur.e de Recherche en analyses génomiques de la diversité de plantes médicinales réunionnaises
Catégorie A – Corps : Ingénieur.e de Recherche en analyses génomiques
Emploi type : BAP – A1A41
UMR : DIADE
Poste ouvert aux contractuels CDD 30 mois
Poste basé à Saint Pierre, La Réunion
Le descriptif de l’employeur
L’IRD est un organisme de recherche public français pluridisciplinaire qui, depuis près de 80 ans, s’engage dans des partenariats équitables avec les pays du Sud et dans les Outre-mer français. Acteur de l’agenda international pour le développement, ses priorités s’inscrivent dans la mise en œuvre des Objectifs de développement durable (ODD). Ensemble, scientifiques et partenaires de l’Institut proposent des solutions concrètes pour répondre aux défis globaux auxquels les sociétés et la planète font face. Cette relation gagnante-gagnante fait de la science et de l’innovation des leviers majeurs du développement. L’Institut est placé sous la double tutelle du ministère chargé de l’Enseignement supérieur et de la Recherche et de celui chargé de l’Europe et des Affaires Étrangères.
La structure que vous allez rejoindre
L’UMR DIADE vise à comprendre la diversification des plantes tropicales, qui constituent un des principaux réservoirs originaux de la biodiversité et pour lesquelles la conservation, la gestion et l’exploitation sont des enjeux majeurs pour un Développement Durable. Les activités que vous mènerez s’insèrent dans le cadre du projet Qualitiz (Projet Feder Réunion 2025-2028) porté par l’IRD (UMR DIADE) et l’Université de La Réunion (UMR PVBMT et laboratoire CHEMBIOPRO). Ce projet vise à étudier la diversité génétique des populations naturelles et cultivées d’une dizaine d’espèces médicinales, endémiques des Mascareignes, afin d’appréhender leur structuration génétique et fournir les connaissances nécessaires à leur valorisation et leur conservation. Pour trois espèces, des analyses génomiques et chimiques complémentaires seront menées afin d’identifier des génotypes performants, élucider les voies de biosynthèse des molécules bioactives ciblées, et identifier les pratiques culturales favorisant leur accumulation, ceci afin de proposer des solutions concrètes aux acteurs de la filière.
Une mission attractive
Votre mission principale sera de prendre en charge les analyses génétiques et génomiques des données du projet Qualitiz et leur valorisation. Dans ce cadre, vos activités seront les suivantes :
• Etudier la diversité génétique des populations naturelles des espèces ciblées après génotypage par séquençage (méthode RADseq ou suite à un enrichissement par capture)
• Mener des analyses phylogénétiques, la clarification botanique de certains taxons, et l’étude de l’histoire démographique des espèces
• Pour 3 espèces, rechercher les facteurs génétiques et environnementaux contrôlant la biosynthèse de molécules bioactives ciblées
• Réaliser l’analyse génomique de familles de gènes impliquées dans la biosynthèse de biomolécules chez deux plantes médicinales, Coffea mauritiana et Psiadia dentata (génome disponible ou en cours de séquençage)
• Participer à la collecte des échantillons de feuilles en milieu naturel (forêts réunionnaises) en accompagnant l’ingénieur en charge de la constitution de l’échantillothèque végétale nécessaire au projet
• Rédiger des articles scientifiques à l’issue des analyses
• Participer au transfert des connaissances auprès des acteurs de la filière ‘plantes médicinales’ de La Réunion
Votre future équipe
Vous serez intégré à l’équipe ADvENS de l’UMR Diade. Vous serez accueilli au sein de la Plateforme 3P à Saint-Pierre. Vous interagirez principalement avec les généticiens du projet (P. Lashermes, UMR Diade, Montpellier, et E. Garot, UMR PVBMT, Saint-Pierre), les physiologistes en charge de l’étude des voies de biosynthèse (T. Joët et S. Dussert, UMR Diade, Montpellier) et l’ingénieur en charge de la collecte des échantillons (CDD Qualitiz, Saint-Pierre). Vous participerez aux réunions regroupant l’ensemble des acteurs du projet (UMR Diade, UMR ChemBioPro, UMR PVBMT et Armeflhor).
Le profil que nous recherchons
Vous avez développé les compétences suivantes :
• Maîtrise des approches de génétique/génomique des populations
• Connaissances en biostatistiques et génétique d’association pour tester les effets environnementaux
• Maîtrise des outils bioinformatiques et de langages de programmation (Python, R, …)
• Capacité rédactionnelle et communication en anglais
Vous faites preuve des qualités humaines suivantes :
• Rigueur
• Organisation
• Autonomie
• Aisance relationnelle
• Sens des responsabilités
• Esprit d’initiative
Vous possédez un diplôme Doctorat (niveau 8). Une première expérience professionnelle dans le domaine est souhaitable.
Rejoindre l’IRD
L’IRD, au cours de votre parcours professionnel, vous accompagne dans le développement de vos compétences.
L’institut met à votre disposition un panel d’outils tel que le parcours digital d’intégration, l’accès à la formation permanente, à la promotion et la mobilité.
En rejoignant l’IRD, vous bénéficierez :
• Rémunération mensuelle brute (incluant indemnité Outre-mer) : 3700-4200€ selon expérience
• De 32 jours de congés + 13 RTT (pour un temps plein à 38h30 hebdomadaire)
• Tickets restaurants
• Souscription annuelle (facultative) à l’Association des Œuvres Sociales : prestations vacances-loisirs et sportives-culturelles
• Participation à hauteur de 15€/mois pour la protection sociale
Pour candidater
Date limite pour candidater : 29 août 2025
Entretiens-sélection : septembre 2025
La prise de poste : 01 décembre 2025
CV et lettre de motivation sont à déposer sur le site IRD Emploi :
https://emploi-recrutement.ird.fr/offre-de-emploi/emploi-ingenieur-e-de-recherche-en-analyses-genomiques-de-la-diversite-de-plantes-medicinales-reunionnaises_486.aspx
+ copie du dossier à thierry.joet@ird.fr, avec pour objet du mail : Candidature IR-Qualitiz
Commentaires récents