Missions. La personne recrutée participera à plusieurs projets financés en cours (ANR, ..). Elle sera en charge de la gestion et du traitement bio-informatique des données en génomique environnementale, évolutive et écologique du projet. Elle participera à la veille technologique, et à la formation des étudiants impliqués dans ces projets.
Activités
– Analyse des données issues des nouvelles méthodes de séquençage NGS (workflow metabarcoding, génomes entiers ou réduits, capture..)
– Programmation (python, C, R, bash, …)
– Soutien aux étudiants
– Aide au stockage et à la gestion des données
– Veille technologique
– Lien avec le service informatique et les autres plateformes bio-informatiques (gérer accès aux clusters de calculs…)
Compétences attendues
– Connaissances et savoir-faire approfondis en bio-informatique.
– Expérience en analyse de données NGS avec maîtrise des principaux outils.
– Bonnes connaissances en langages et environnements informatiques (Python, R, ).
– Connaissances en bases de données appliquées à l’analyse de données de génomique.
– Connaissance en biologie moléculaire
– Intérêt pour la biologie évolutive et pour l’écologie.
– Anglais avancé.
– Des connaissances en génétique des populations seraient un plus
Contexte de travail
La personne recrutée travaillera dans un groupe de 10 personnes environ (un CDD bio-informatique, des doctorants et des stagiaires)
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