Contexte :
Dans le cadre d’un projet ANR PRCE 2024 (MICROMYCESS) l’unité d’œnologie de
l’université de Bordeaux et l’entreprise BiolaTort recrutent un étudiant niveau M2 pour
réaliser des expériences de phénotypage multi-échelle sur des souches de levures de
l’espèce Saccharomyces cerevisiae. Ce travail s’inscrit dans un cadre plus vaste qui vise
à réaliser des travaux de cartographie génétique sur une très large descendance (2000
individus) avec des approches de GWAS multi-environnement. Ce projet sera réalisé
dans le cadre d’une thèse financée par l’ANR à partir d’octobre 2025 (financement
acquis).
Objectifs :
Le projet MICROMYCESS vise à optimiser les stratégies de sélection des levures
œnologiques en les rendant plus adaptées aux conditions de fermentations nouvelles
générée par le changement climatique. L’objectif de ce stage est de mieux caractériser
la réponse phénotypique d’une vingtaine de souches de levures à des variations du
niveau de maturité des raisins. Ce travail permettra également d’optimiser les protocoles
expérimentaux nécessaires à la réalisation d’un phénotypage massif nécessaire pour la
réalisation de programmes GWAS à large échelle.
MéthodologieAu cours des 5 à 6 mois de stage, le(a) canditat(e) réalisera des fermentations
alcooliques à l’aide d’une plateforme robotisée dans diTérentes matrices œnologiques.
La plateforme robotisée permet un suivit de la fermentation alcoolique en temp réel et
d’estimer la vitesse du flux glycolytique de 190 fermenteurs en parallèle. Le métabolome
non volatile des vins produits sera analysé en LC-HRMS permettant de quantifier
plusieurs milliers de métabolites et de connaitre leur nature chimique. La réalisation
d’analyses statistiques multivariées et la gestion d’un pipeline de métabolomique à
l’aide du logiciel R feront partie intégrante de ce stage.
Prérequis :
Candidat(e) intéressé(e) par des approches transversales entre biologie, chimie et
génétique.
Candidat(e) intéressé(e) par la variabilité génétique naturelle et la microbiologie
industrielle.
Candidat(e) intéressé(e) par l’œnologie.
La motivation d’une poursuite en thèse est un plus pour ce stage.
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