Proposition de stage de Master 2 – Septentrion Environnement
Niveau d’étude :
• Stage de Master 2 en écologie ou écologie marine, durée de 5 à 6 mois consécutifs
Domaine : écologie marine, environnement, conservation
Intitulé :
Caractérisation comparée de l’état et de la dynamique des populations de corail rouge (Corallium rubrum) du Parc national des Calanques (Marseille), de la Réserve Naturelle de Cerbère-Banyuls (Occitanie), et du Parc Naturel Marin du Golfe du Lion (Occitanie).
Contexte :
Le Parc national des Calanques (PnCal) a été officiellement créé en 2012. Dans le cadre de son plan de gestion, il a été décidé un certain nombre d’études scientifiques visant à caractériser l’état initial de l’environnement marin et terrestre, aussi bien sur les plans biologique que socio-économique par exemple. Ce type d’étude de l’état initial permet de définir des enjeux de gestion et de mettre en œuvre un plan d’actions. En ce qui concerne les biotopes et biocénoses naturelles, ces études de l’état « zéro » permettent de doter le gestionnaire d’un état de référence du milieu, nécessaire pour son suivi et sa gestion à long terme. Il a notamment été réalisé en 2013 une étude de l’état Zéro des populations de corail rouge (Corallium rubrum) du Parc national des Calanques (Berman et al., 2014). Ceci donnait suite à certaines études précédentes concernant cette espèce (Garrabou et al., 2001; Marschal et al., 2004; Torrents et al., 2005, 2008). Cette mission, commandée par le Parc national des Calanques, a été confiée à l’association Septentrion Environnement (SE) dans le cadre d’une large étude « point zéro » dont la réalisation a été coordonnée par le GIS Posidonie, incluant l’étude de divers compartiments biologiques. En 2018, SE a également réalisé en collaboration avec Comex SA l’étude à T0 + 5 ans des populations de Corail rouge du PnCal (Richaume et al., 2021). Aujourd’hui, dans un contexte où les vagues de chaleurs marines sont de plus en plus intenses et récurrentes (Estaque et al., 2023), nous poursuivons ces suivis à T0 + 10 ans.
En parallèle, nous réalisons en réponse à une problématique similaire et avec la même méthodologie, depuis 2013, le suivi des populations de corail rouge d’une autre aire d’étude : celles du Parc Marin du Golfe du Lion et de la Réserve Marine de Cerbère Banyuls. Cette année nous réalisons le suivi de ces même populations à T0 + 10 ans.
Objectifs et contenus du stage :
La caractérisation des populations de corail rouge se fait via l’analyse des données issues de techniques de photogrammétrie : des photos prises in situ par un plongeur permettent au laboratoire de mesurer sur ordinateur un certain nombre de paramètres caractérisant les colonies (Ledoux et al., 2010; Linares et al., 2012; Richaume et al., 2021). Le/la stagiaire réalisera des analyses de ce type de photos et des données ainsi obtenues par la photogrammétrie. Il s’agira d’étudier les paramètres démographiques de plusieurs populations situées dans et hors « zone de non-prélèvement ». Les données décrivant les populations en 2023 pour les différentes aires d’étude mentionnées ci-dessus seront comparées entre elles et comparées aux données issues des études précédentes.
Trois principales activités seront à réaliser :
1) Analyses statistiques sur des paramètres décrivant les populations de corail rouge du PnCal vivant entre la surface et 40 m de profondeur. Ces données proviennent de jeux de photos déjà analysées via photogrammétrie. Les analyses seront intégrées comme contribution à un rapport de projet avant fin mars 2025.
2) Réalisation des analyses photogrammétriques de photos acquises sur des populations de corail rouge du PnCal vivant entre 50 m et 300 m de profondeur. Analyses statistiques des paramètres descriptifs des populations ainsi obtenus. Contribution à la rédaction du rapport de projet à remettre au PnCal avant septembre 2025. Participation aux réunions de suivis du projet avec le PnCal.
3) Réalisation des analyses photogrammétriques de photos acquises sur des populations de corail rouge du Parc Marin du Golfe du Lion et de la Réserve Marine de Cerbère Banyuls. Analyses statistiques des paramètres descriptifs des populations. Contribution à la rédaction du rapport de projet d’ici juin 2025.
Le stage, d’une durée minimum de 5 mois, se déroulera entre janvier et août 2025 (calendrier modulable). Le stagiaire travaillera sur plateforme informatique dans les bureaux de Septentrion Environnement. Il s’agira de traiter des séries de photos de suivis des populations de Corallium rubrum. Le stagiaire sera donc formé à l’utilisation des logiciels spécifiques, participera à l’analyse-interprétation des résultats et préconisations aux gestionnaires. De manière ponctuelle, il pourra être amené à participer aux autres activités de l’association, notamment des sorties en mer (en fonction de ses qualifications de plongée/pilotage, …).
Conditions d’accueil du stage, moyens mis à disposition :
Période :
– Format Master 2 : Le stage, d’une durée cumulée de minimum 5 mois et de 6 mois au maximum, se déroulera entre Janvier et Aout 2025 (calendrier modulable : au-delà de la soutenance du stage, une prolongation de la convention pourrait éventuellement être envisagée sur quelques semaines)
Structure d’accueil : Septentrion Environnement, 89 Traverse Parangon, Lycée professionnel agricole des Calanques, 13008 MARSEILLE. Web : www.septentrion-env.com
Institut de recherche et de formation en écologie marine, à statut associatif (loi 1901), reconnue d’intérêt général, basée à Marseille depuis 2007, Septentrion Environnement axe son travail sur trois volets :
– Des études scientifiques : participer, en lien avec les unités de recherche (CNRS, CSIC, …), à l’amélioration de la connaissance des écosystèmes marins, notamment dans l’optique de leur gestion ;
– Des formations en environnement des professionnels et futurs professionnels de ces domaines (écologie marine, plongée scientifique, gestion des zones côtières, …) ;
– Des actions de transfert et sensibilisation du grand public via des opérations variées.
L’association regroupe une équipe de 12 salariés permanents et des bénévoles participant régulièrement à ses activités.
Encadrants du stage :
Olivier Bianchimani, Directeur ; olivier.bianchimani@septentrion-env.com
Tristan Estaque, chargé de missions scientifiques ; tristan.estaque@septentrion-env.com
Adrien Cheminée, Dr., Directeur scientifique et pédagogique ; adrien.cheminee@septentrion-env.com
Conditions financières :
– Format stage M2 : Indemnité de stage selon tarifs en vigueur en 2025 (de l’ordre de 600€/mois net) + remboursement des frais de missions.
Conditions matérielles et perspectives :
Le stagiaire travaillera sur plateforme informatique dans les bureaux de l’association.
Ce sujet ne prévoit pas de suite en thèse au sein de l’association.
Profil recherché :
– Stage Master 2.
– Compétences essentielles : Connaissances en écologie marine ; un fort intérêt et de l’expérience en traitements et analyses statistiques des données écologiques : les activités du stage sont en grande partie du traitement de données nécessitant une bonne maitrise du langage de programmation R ; Rédaction scientifique ;
Autonomie, prise d’initiative ; Esprit d’équipe.
– Compétences optionnelles appréciées : Permis bateau et expérience en plongée sous-marine.
ENVOYER CV ET LETTRE DE MOTIVATION AUX PERSONNES DE CONTACTS INDIQUEES CI-DESSUS.
DATE LIMITE DE CANDIDATURE : 05/11/2024
Références (voir aussi : https://www.septentrion-env.com/documentation/ ) :
Berman, L., Bianchimani, O., Garrabou, J., Drap, P., Payrot, J., Acornero-Picon, A., Clement, A.L., Cheminée, A., 2014. Characterizing Corallium rubrum populations of two Mediterranean MPAS: structuring factors and dynamics. Presented at the 2nd Mediterranean Symposium on the conservation of Coralligenous & other Calcareous Bio-Concretions, Regional Activity Centre for Specially Protected Areas, Portorož, Slovenia.
Estaque, T., Richaume, J., Bianchimani, O., Schull, Q., Mérigot, B., Bensoussan, N., Bonhomme, P., Vouriot, P., Sartoretto, S., Monfort, T., Basthard-Bogain, S., Fargetton, M., Gatti, G., Barth, L., Cheminée, A., Garrabou, J., 2023. Marine heatwaves on the rise: One of the strongest ever observed mass mortality event in temperate gorgonians. Glob. Change Biol. n/a. https://doi.org/10.1111/gcb.16931
Garrabou, J., Perez, T., Sartoretto, S., Harmelin, J., 2001. Mass mortality event in red coral Corallium rubrum populations in the Provence region (France, NW Mediterranean). Mar. Ecol. Prog. Ser. 217, 263–272. https://doi.org/10.3354/meps217263
Ledoux, J., Garrabou, J., Bianchimani, O., Drap, P., FÉRAL, J., Aurelle, D., 2010. Fine‐scale genetic structure and inferences on population biology in the threatened Mediterranean red coral, Corallium rubrum. Mol. Ecol. 19, 4204–4216.
Linares, C., Garrabou, J., Hereu, B., Diaz, D., Marschal, C., Sala, E., Zabala, M., 2012. Assessing the Effectiveness of Marine Reserves on Unsustainably Harvested Long‐Lived Sessile Invertebrates. Conserv. Biol. 26, 88–96.
Marschal, C., Garrabou, J., Harmelin, J., Pichon, M., 2004. A new method for measuring growth and age in the precious red coral Corallium rubrum (L.). Coral Reefs 23, 423–432.
Richaume, J., Cheminée, A., Drap, P., Bonhomme, P., Cadene, F., Ferrari, B., Hartmann, V., Michez, N., Bianchimani, O., 2021. 3D Photogrammetry Modeling Highlights Efficient Reserve Effect Apparition After 5 Years and Stillness After 40 for Red Coral (Corallium rubrum) Conservation in French MPAs. Front. Mar. Sci. 8, 1174.
Torrents, O., Garrabou, J., Marschal, C., Harmelin, J., 2005. Age and size at first reproduction in the commercially exploited red coral Corallium rubrum(L.) in the Marseilles area (France, NW Mediterranean). Biol. Conserv. 121, 391–397.
Torrents, O., Tambutté, E., Caminiti, N., Garrabou, J., 2008. Upper thermal thresholds of shallow vs. deep populations of the precious Mediterranean red coral Corallium rubrum(L.): Assessing the potential effects of warming in the NW Mediterranean. J. Exp. Mar. Biol. Ecol. 357, 7–19.
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