Présentation du projet :

Les changements environnementaux auxquels sont confrontés les écosystèmes peuvent avoir des
conséquences importantes sur l’état physiologique des organismes et, plus largement, sur leur
capacité à assurer les fonctions essentielles à leur développement, leur reproduction et leur survie.
Parmi les indicateurs permettant d’évaluer cet état, la condition corporelle constitue une mesure
particulièrement intéressante, car elle renseigne sur les réserves énergétiques disponibles chez les
animaux. Elle peut ainsi refléter leur capacité à acquérir et à stocker de l’énergie, avec des
conséquences potentielles sur des traits d’histoire de vie tels que la croissance, la reproduction et la
survie.

Plusieurs études récentes menées en milieu marin ont mis en évidence une diminution de cette
condition corporelle au cours des dernières décennies chez un nombre important d’espèces de
poissons, avec des répercussions notamment sur la taille et la survie des individus. Ce déclin est
généralement attribué à l’évolution des conditions environnementales (réchauffement des eaux,
modification de la disponibilité alimentaire, changements hydrologiques), bien que les effets directs
ou indirects de la pêche puissent également y contribuer. En revanche, les tendances à long terme de
la condition corporelle des poissons d’eau douce demeurent beaucoup moins documentées. Les
écosystèmes fluviaux sont pourtant soumis à de multiples pressions anthropiques et climatiques
susceptibles d’affecter l’état physiologique des populations. Dans ce contexte, mieux caractériser les
tendances à long terme de la condition corporelle des poissons d’eau douce apparaît essentiel pour
mieux comprendre les effets cumulés de ces pressions sur les populations et anticiper leurs
conséquences sur le fonctionnement des écosystèmes aquatiques.

Objectifs du stage

L’objectif de ce stage est de déterminer si des tendances similaires à celles observées en milieu marin
existent chez les poissons des cours d’eau français. Plus précisément, le stage visera à :

– Caractériser les variations spatiales et temporelles de la condition corporelle des poissons à
l’échelle de la France hexagonale ;
– Identifier les espèces présentant des tendances significatives d’amélioration ou de
dégradation de leur condition corporelle ;
– Explorer le rôle de multiples facteurs environnementaux (température, hydrologie, activités
anthropiques, caractéristiques des habitats, etc.) sur les tendances observées de la condition
corporelle.

Données disponibles

Le travail s’appuiera sur une base de données issue des réseaux de suivi des communautés de poissons
des cours d’eau français, comprenant près de 6 millions de tailles individuelles, 3 millions de poids
corporels mesurés, et couvrant environ 60 espèces de poissons et plusieurs décennies d’observations
(1995-2022). Ces données sont associées à un catalogue de métriques provenant d’une seconde base
de données et représentant les forçages physiographiques naturels et les pressions d’origine
anthropique existantes (e.g. température de l’eau, hydrologie, utilisation des sols, contaminants).
L’association de ces bases de données constitue une opportunité unique pour étudier les réponses des
communautés piscicoles aux changements environnementaux à l’échelle nationale.
Les méthodes employées iront des statistiques univariées et multivariées aux modèles spatio-
temporels.

Porteurs :

– Tutelles : IARA : Pablo Brosset / INRAE : Alain Danet, Olivier Dézerald / Ifremer : Morgane Travers-Trolet
– Site du stage : Rennes – Institut Agro
Pablo Brosset : pablo.brosset@institut-agro.fr
Alain Danet : alain.danet@inrae.fr
Olivier Dézerald : olivier.dezerald@inrae.fr
Morgane Travers-Trolet : morgane.travers@ifremer.fr

Date limite de candidature au 1/11/2026, en joignant CV + LM + dates approximatives de stage
demandées par votre université aux 4 encadrants. Attention, les candidatures seront évaluées au fil
de l’eau jusqu’à ce que le stage soit pourvu.

Références :

Gernez, Savina-Rolland, Gascuel, Travers-Trolet. (2025) Body condition decline in Western european
fishes. Marine Environmental Research. Volume 211.
https://doi.org/10.1016/j.marenvres.2025.107428.

Brosset, P., Fromentin, J. M., Van Beveren, E., Lloret, J., Marques, V., Basilone, G., … & Saraux, C.
(2017). Spatio-temporal patterns and environmental controls of small pelagic fish body condition from
contrasted Mediterranean areas. Progress in oceanography, 151, 149-162

Irons, K.S., Sass, G.G., McClelland, M.A. and Stafford, J.D. (2007), Reduced condition factor of two
native fish species coincident with invasion of non-native Asian carps in the Illinois River, U.S.A. Is this
evidence for competition and reduced fitness?. Journal of Fish Biology, 71: 258-273.
https://doi.org/10.1111/j.1095-8649.2007.01670.x

Maceda-Veiga, A., Green, A.J. and De Sostoa, A. (2014), Scaled body-mass index shows how habitat
quality influences the condition of four fish taxa in north-eastern Spain and provides a novel indicator
of ecosystem health. Freshw Biol, 59: 1145-1160. https://doi.org/10.1111/fwb.12336

Dézerald, Bourillon, Mirabel, Moussay, Kreutzenberger. AMOBIO : Analyse multicritère des effets
exercés par les obstacles en cours d’eau sur les communautés biologiques (diatomées,
macroinvertébrés, poissons). (2025). Rapport scientifique et technique final. Office français de la
biodiversité (OFB); Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement
(INRAE). 81 p. + annexes.

Pascal Irz, Thibault Vigneron, Nicolas Poulet, Eddy Cosson, Thierry Point, et al.. A long-term monitoring
database on fish and crayfish species in French rivers. Knowledge and Management of Aquatic
Ecosystems, 2022, 423, pp.25. ⟨10.1051/kmae/2022021⟩.

Le contenu de cette offre est la responsabilité de ses auteurs. Pour toute question relative à cette offre en particulier (date, lieu, mode de candidature, etc.), merci de les contacter directement. Un email de contact est disponible: alain.danet@inrae.fr

Pour toute autre question, vous pouvez contacter sfecodiff@sfecologie.org.