Parmi les insectes utilisés en entomoculture, la mouche soldat noire (Hermetia illucens) communément appelée BSF, apparaît comme une espèce intéressante car ses larves sont des agents bioconverteurs efficaces, se nourrissant de déchets organiques. Les farines protéiques et les huiles produites après extraction sont utilisées en alimentation animale ou en « pet food » permettant de formuler des aliments à hautes valeurs nutritives.
Pour assurer la viabilité et la productivité à long terme, la gestion de la diversité génétique des populations de BSF en entomoculture est cruciale afin d’atténuer les effets négatifs de la consanguinité. Récemment, une étude a fourni les premières preuves de polyandrie chez la BSF avec des femelles multi-accouplées pouvant pondre des œufs plusieurs fois, augmentant ainsi la production d’œufs, dans des conditions de reproduction de masse. Chez les espèces polyandres, la compétition entre les mâles pour la paternité de la progéniture se poursuit après la copulation par la compétition de leurs éjaculats pour la fertilisation des ovocytes de la femelle. Chez cet insecte, la femelle a une spermathèque complexe dans laquelle le mâle transfère des spermatozoïdes très longs mêlés à des fluides , Chez les espèces polyandres (= chez lesquelles la femelle s’accouple avec plusieurs mâles), différents modèles de compétition spermatique prédisent une plasticité adaptative dans la production et l’allocation de spermatozoïdes par les mâles. Ces prédictions ont été récemment testées expérimentalement chez la BSF , et l’objectif de ce stage est de réaliser une étude d’assignation de paternité afin de quantifier les contributions paternelles dans la progéniture des femelles. L’estimation précise des contributions gamétiques maternelles et paternelles, dans chaque descendance de populations de BSF, étant cruciale pour la mise en place de programmes efficaces d’amélioration génétique chez l’espèce. Pour la réalisation du stage, plus d’un millier de larves seront génotypées avec la première puce de génotypage KASPAR mis au point chez la BSF et les assignations seront réalisées avec la méthode d’exclusion implémentée dans le logiciel APIS (auto-adaptative parentage inference solftware).
Cette étude s’inscrit dans le programme BioSexFly qui vise à mieux connaitre la reproduction de la BSF avec un objectif fondamental (la compréhension des mécanismes de sélection sexuelle) et appliqué (la sélection génétique). Et les résultats de ce stage contribueront à l’établissement de stratégies de gestion génétique efficaces pour l’élevage de BSF, assurant ainsi la durabilité à long terme de cette filière industrielle naissante.
Le (la) stagiaire sera entouré(e) des généticiens du SYSAAF pour l’aider dans la génération/compréhension des données et dans leurs analyses et interprétations. L’IRBI, également impliqué dans ce projet fournira non seulement les échantillons de familles de BSF à génotyper, mais viendront également en appui sur les aspects relatifs à la biologie et zootechnie de l’espèce.
Structure d’accueil :
Le stage sera réalisé au SYSAAF, Centre INRAE – Val de Loire, Unité Mixte de Recherche – Biologie des Oiseaux et Aviculture, 37380 Nouzilly.
Le SYSAAF a une activité de « Centre technique » dont la mission est d’apporter un appui technique à la sélection génétique d’une 30aine d’espèces avicoles, aquacoles et entomocoles auprès d’une 40aine d’entreprises de sélection et/ou de gestion de populations (www.sysaaf.fr).
Profil et compétences recherchées :
De formation Master ou Ecole d’ingénieurs en biologie/agronomie ou disciplines connexes, le (la) stagiaire devra avoir compétences suivantes : génétique animale ou végétale, tests d’hypothèses statistiques classiques avec le logiciel R, autonomie, rigueur au travail, capacités de synthèse, d’analyse de données et rédactionnelles, ainsi qu’un bon relationnel
Avantage :
Outre la rémunération au tarif réglementaire, le (la) stagiaire aura accès au restaurant d’entreprise (tarif négocié) ainsi qu’à la navette de déplacement Tours-Nouzilly-Tours disponible pour les agents travaillant sur le centre INRAE Val de Loire de Nouzilly.
Durée et date de début : 6 mois, à partir de février 2025
Les candidatures (joindre impérativement une lettre de motivation à votre CV) devront être transmises à Armel Donkpegan, Chargé de projets sélection entomocole au SYSAAF (armel.donkpegan@inrae.fr), avec copie à Christophe Bressac (christophe.bressac@univ-tours.fr) et Frédéric Manas (frederic.manas@univ-tours.fr)
Bibliographie:
Muraro, T.; Lalanne, L.; Pelozuelo, L.; Calas-List, D. Mating and Oviposition of a Breeding Strain of Black Soldier Fly Hermetia illucens (Diptera: Stratiomyidae): Polygynandry and Multiple Egg-Laying. J. Insects Food Feed 2024, 10, 1423–1435.
Munsch-Masset P, Labrousse C., Beaugeard L. & Bressac C. 2023.The reproductive tract of the black soldier fly (Hermetia illucens) is highly differentiated and suggests adaptations to sexual selection. Entomologia Experimentalis et Applicata 171 (11): 857-866. https://doi.org/10.1111/eea.13358
Manas F, Labrousse C, Bressac C (2023) Sperm production and allocation respond to perceived risk of sperm competition in the black soldier fly Hermetia illucens, bioRxiv 2023-06; https://doi.org/10.1101/2023.06.20.544772
Manas F, Piterois H, Labrousse C, Beaugard L, Uzbekov R, Bressac C (2024) Gone but not forgotten: dynamics of sperm storage and potential ejaculate digestion in the black soldier fly Hermetia illucens, Royal Society Open Science https://doi.org/10.1101/2024.05.31.596011
Donkpegan A., Guigue A., Boulanger F-X., Brard-FuduleaS., Haffray P., Sourdioux M., and Rouger R. (2021). High-density SNP development in black soldier (Hermetia illucens L.) via throughput DNA Pool Sequencing. sciencesconf.org:eags-2021:373268
Griot & al. 2020. APIS : An auto-adaptative parentage inference solftware that tolerates missing parents. Molecular Ecology Resources, 20:579–590
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