L’outil de surveillance syndromique du dispositif OMAR (Observatoire de la Mortalité des Animaux
de Rente) permet un suivi hebdomadaire de la mortalité dans le cheptel bovin et émet des alarmes
à l’échelle zonale (agrégat de communes) en cas de surmortalités.
L’objectif du stage est d’identifier les modalités permettant de réaliser une évaluation de l’impact
d’une maladie connue sur la mortalité bovine (e.g. approcher une quantification de morts pouvant
être rattachée à cette maladie). Cela consistera à identifier et mettre en oeuvre la / les méthodes
permettant de mesurer les corrélations entre les alarmes zonales du dispositif Omar bovins et les
informations relatives à des foyers de maladie.
Le stage sera mené en prenant comme cas pratique l’évaluation de l’impact sur la mortalité de la
Maladie hémorragique épizootique (MHE) et de la Fièvre catarrhale ovine (FCO, causée par le
Bluetongue virus, BTV-8 et BTV-3) en 2023-2024. Ces deux maladies affectent le cheptel français
et européen ces dernières années ; elles sont causées par des virus transmis d’un animal à l’autre
par piqûre de moucherons. L’analyse des données dans les zones touchées (agrégats de
communes) simultanément par les deux maladies par rapport à celles affectées par une seule
permettra d’étudier l’impact de deux phénomènes concomitants. Selon les résultats obtenus, des
propositions pourront être faites pour la mise en oeuvre d’un outil opérationnel qui viendra compléter ceux existants dans le dispositif Omar bovins.
Dans ce cadre, les activités réalisées au cours du stage incluent :
– Recherche bibliographique sur :
– Mortalité bovine, Maladie hémorragique épizootique (MHE) et Fièvre catarrhale
ovine (FCO)
– Méthodes statistiques d’analyse des corrélations temporelles et spatiales (ex : coefficient de corrélation, régressions
linéaires simple et multiple, analyse de corrélation croisée, etc.)
– Analyses de corrélation des alarmes Omar et des cas de maladie par différentes approches
– Evaluation des performances des outils de corrélation selon les caractéristiques des alertes et des nombres de cas de
MHE et FCO en France (à différentes échelles spatiales et temporelles)
– Cartographie et analyse spatiale des alarmes Omar et des cas de MHE et FCO en France
– Rédaction d’un rapport de stage et présentation en séminaire du laboratoire
Merci de consulter la fiche de stage complète: http://mesechanges.anses.fr/HTCOMNET/Handlers/AnonymousDownload.ashx?file=4ccf3dd4
Date limite de réponse : 25/10/2025
Renseignements sur le stage : Julie Teresa SHAPIRO, chargée de recherche (julie.shapiro@anses.fr) ou Viviane HÉNAUX,
cheffe-adjointe Unité EAS (viviane.henaux@anses.fr)
Adresser les candidatures par courriel (lettre de motivation + cv) en indiquant la référence Stage-OMAR à :
Julie Teresa SHAPIRO, chargée de recherche (julie.shapiro@anses.fr) et Viviane HÉNAUX, cheffe adjointe Unité EAS
(viviane.henaux@anses.fr)
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