Bonjour,
Voici ci-dessous une annonce d’un projet de thèse dont le financement est acquis (50% Région / 50% ED) et qui débutera en octobre 2024, au sein de l’unité Évolution, Écologie, Paléontologie, UMR CNRS 8198, Université de Lille.
Amicalement,
Anne Duputié, Isabelle De Cauwer & Jean-François Arnaud
(Please find an English version below)
Sujet de la thèse :
Gestion et conservation d’une espèce à forte valeur patrimoniale, la Pensée des Dunes (Viola tricolor ssp. curtisii) : évolution du régime de reproduction et du succès reproducteur en centre et limite d’aire de répartition géographique.
Encadrants : Anne Duputié (MCF), Isabelle De Cauwer (MCF), Jean-François Arnaud (PR)
Lieu : Unité Évolution, Écologie et Paléontologie
UMR 8198 CNRS / Université de Lille – Faculté des Sciences et Technologies
59655 Villeneuve d’Ascq cedex, France.
Procédure de candidature :
Les dossiers de candidature doivent comporter un CV détaillé (diplômes et notes déjà obtenus, sujets de stages pratiques), une lettre de motivation et les coordonnées ou une lettre d’appréciation de deux référents, et devront être adressés à Anne Duputié (anne.duputie@univ-lille.fr ), à Isabelle De Cauwer (isabelle.de-cauwer@univ-lille.fr) et à Jean-François Arnaud (jean-francois.arnaud@univ-lille.fr) au plus tard le 15/05/2024.
Profil du candidat :
Le/la candidat/e doit être titulaire d’un diplôme de master en écologie ou biologie évolutive, et avoir un attrait pour le travail de terrain, les expérimentations en milieu contrôlé, la biologie moléculaire et les analyses statistiques. Une première expérience dans l’un ou plusieurs de ces domaines serait appréciée. Le/la candidat/e doit avoir de bonnes aptitudes de communication orale et écrite.
Résumé du projet de thèse :
La structure génétique des espèces est influencée par des facteurs spatiaux et des caractéristiques liées à leur traits d’histoire de vie, notamment leur mode de reproduction et leur capacité de dispersion. Ces facteurs donnent lieu à des patrons géographiques identifiables à l’échelle de leur aire de répartition ainsi qu’à une échelle très locale. Ces patrons peuvent refléter à la fois des adaptations spécifiques et des variations fortuites qui n’ont pas été gommées par des processus uniformisants, comme les flux de gènes.
Cette thèse explorera l’évolution du régime de reproduction d’une espèce végétale protégée à forte valeur patrimoniale, la pensée des dunes (Viola tricolor subsp. curtisii), et son impact en termes de niveaux de diversité génétique et de succès reproducteur des individus. La limite géographique sud de la pensée des dunes se trouve sur le littoral des Hauts-de-France, où les populations sont exposées aux perturbations anthropiques du cordon dunaire et à une possible réduction de la densité des pollinisateurs. Un gradient déclinant de diversité génétique du centre vers la limite de distribution de l’espèce a déjà été montré, le patron inverse étant observé concernant les taux d’autofécondation et les niveaux de différenciation génétique. Les objectifs de cette thèse sont les suivants :
• Analyser les déterminants de la variation du régime de reproduction au niveau intra-population en lien avec les traits floraux et l’abondance des pollinisateurs, tout en évaluant la limitation pollinique in situ.
• Estimer l’évolution des traits floraux et du système de reproduction en centre et en limite d’aire de répartition au cours d’une dizaine de générations.
• Évaluer la possibilité de renforcement des populations des Hauts-de-France avec des individus des Pays-Bas en tenant compte de leur disparité génétique, et formuler des recommandations opérationnelles pour la gestion conservatoire.
• Établir si la pensée des dunes s’hybride avec des espèces voisines dans les sites naturels, et le cas échéant, formuler des recommandations de gestion pour ces sites.
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PhD offer
We propose a fully funded 3-year PhD fellowship starting in October 2024, aiming at characterizing the evolution of the mating system of a protected plant species with high conservation value, the Dune Pansy (Viola tricolor ssp. curtisii). The student will be based at University of Lille.
Title of the thesis: Conservation and management of an endangered species, the dune pansy (Viola tricolor ssp. curtisii): mating system evolution and reproductive success along its geographic range.
Supervisors : Anne Duputié (MCF), Isabelle De Cauwer (MCF), Jean-François Arnaud (PR)
Location : Unité Évolution, Écologie et Paléontologie
UMR 8198 CNRS / Université de Lille – Faculté des Sciences et Technologies
59655 Villeneuve d’Ascq cedex, France.
How to apply:
To apply, please send:
– a CV
– a short motivation letter (max 1 page)
– university certificates with official grades in a single PDF
– contact details from two referees and/or recommendation letters
to Jean-François Arnaud (jean-francois.arnaud@univ-lille.fr), Anne Duputié (anne.duputie@univ-lille.fr) and Isabelle De Cauwer (isabelle.de-cauwer@univ-lille.fr).
Only complete applications received by 15 May 2024 will be considered. The selection criteria will be the excellence of the curriculum vitae and the adequacy between the professional project of the candidate and the thesis subject.
Requested skills: The candidate must hold a Master’s degree in ecology or evolutionary biology, and have an interest in fieldwork, experiments in controlled environments, molecular biology and statistical analysis. Initial experience in one or more of these fields would be appreciated. Good oral and written communication skills are required.
Summary of PhD project:
Species specific patterns of genetic structure are influenced by spatial factors and by life-history traits, especially reproductive and dispersal related traits. These factors generate striking spatial genetic structure both at the scale of the species’ distribution range but also at very fine scales of investigation. These spatial genetic patterns reflect both local adaptations and random variations that are not homogenized by gene flow.
This thesis will explore the evolution of the mating system of a protected plant species with high conservation value, the Dune Pansy, and its impact on the levels of genetic diversity and on the reproductive success of individuals. The southern boundary of the geographic range of the Dune Pansy extends along the coastline of the “Hauts-de-France” region, where populations are exposed to anthropogenic disturbances along the coastline and to potential reduction in pollinator density. A biogeographical break has been observed between core and marginal populations, with trailing-edge populations showing higher levels of genetic differentiation, reduced genetic diversity, and higher levels of selfing estimated through progeny arrays.
The objectives of this thesis are as follows:
• Analysing the intra-population sources of variation in mating system (propensity for selfing) in relation to floral traits and pollinator abundance, while assessing pollen limitation in situ.
• Evaluating the evolution of floral traits and the mating system at the center and the edge of the geographic distribution of the species over a few generations.
• Assessing the feasibility of reinforcing wild populations located in the “Hauts-de-France” region using individuals coming from the Netherlands, evaluate their genetic disparity, and formulate operational recommendations for conservation management.
• Determine if the Dune Pansy hybridizes with closely-related species in natural habitats, and if so, formulate management recommendations for these sites.
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