STRUCTURE* : Université de Mayotte.
INTITULÉ DU STAGE* : Développement d’indicateurs biologiques « éponge marine » adapté au suivi de la qualité du lagon mahorais
ENCADRANT: le stagiaire sera encadré par Emmanuel CORSE
EMAIL* : emmanuel.corse@univ-mayotte.fr
DURÉE DU STAGE : 6 mois
NIVEAU SOUHAITÉE : STAGE MASTER 2E ANNÉE
PARCOURS VISÉ : Master Biostatistiques/ Master d’écologie / biologie marine
PERIODE : février – juillet 2025
COMPETENCES REQUISES ET SOUHAITEES : Analyses statistiques en biologie, connaissance des concepts et outils en écologie des communautés, familier avec les logiciels statistiques : R et/ou Python, maîtrise des outils SIG appréciés. Formation plongée appréciée.
CONTEXTE
Le lagon mahorais est l’objet de forçages anthropiques importants associés à l’explosion démographique et au développement accéléré que connaît l’île depuis le début du XXIème siècle. Ces pressions se traduisent notamment par une altération des habitats du lagon (e.g. envasement du substrat, turbidité) et une diffusion accrue des eaux de surface souillées (assainissement insuffisant) dans les eaux marines. L’un des enjeux environnementaux est donc de bien comprendre par quels processus l’anthropisation de l’île impacte les communautés des différents biotopes caractéristiques de Mayotte.
Les éponges représentent un groupe écologique clé dans les écosystèmes marins de par leur rôle fonctionnel (i.e. organismes filtreurs) où elles sont reconnues pour leurs importantes capacités de filtration d’eau et de recyclage en nutriments. Par ailleurs, ce rôle fonctionnel de filtreurs dans le récif corallien rend les éponges particulièrement sensibles à la qualité du milieu, i.e. faisant d’elles un compartiment biologique pertinent pour suivre les effets de l’anthropisation sur les communautés aquatiques.
Différents projets visant à prospecter l’intérêt de leur utilisation pour répondre à des problématiques environnementales du lagon Mahorais se succèdent depuis 2019. L’une des approches vise à étudier les relations entre les variations spatiales des communautés d’éponges du récif frangeant avec le niveau d’anthropisation des bassins versants adjacents (projets EpoDic I & II). Une première campagne réalisées entre 2020-2022 sur 30 stations a permise de caractériser ces variations spatiales et a montré le lien fort qu’elles avaient avec différents facteurs environnementaux, comme le niveau d’urbanisation des bassins versants adjacents ou l’état d’envasement des habitats. Il est prévu de réaliser une nouvelle campagne sur ces mêmes sites en 2025 (EpoDic III) afin d’intégrer les variations temporelles de ces communautés. A partir de ces données il est envisagé de développer des indices biologiques basés sur les abondances d’éponges rendant compte de l’impact de l’anthropisation du milieu, dans la perspective de pérenniser un suivi biologique.
OBJET DU STAGE
Le stage aura donc pour objet le développement d’indices biologiques « éponges », en s’inspirant des approches basées sur l’évaluation des écarts à un état de référence et des approches multivariées (voir bibliographie ci-dessous). Il est donc attendu une bonne maitrise des outils de biostatistiques. L’étudiant aura à disposition l’ensemble des données d’abondance obtenues précédemment, ainsi que les données d’habitats, et aura accès à mesure de l’avancé de la campagne d’échantillonnage 2025 à de nouvelles données sur ces mêmes sites. L’étudiant pourra dans la mesure de ses qualifications hyperbares (être classé CAH mention 0b minimum) participer aux nombreuses sorties terrain qui auront lieu dans le lagon.
L’étudiant sera accueilli à l’Université de Mayotte, basé à Dembéni. L’encadrement de son stage sera assuré par Emmanuel Corse, maîtres de conférences en biologie. L’étudiant pourra compter sur l’expérience de l’UMay qui accueille depuis plusieurs années de nombreux stagiaires de master en biologie marine. L’étudiant aura accès aux équipements de l’UMay pour accomplir ses tâches.
POUR CANDIDATER : Envoyer une lettre de motivation 1 page maximum + un CV à l’adresse : emmanuel.corse@univ-mayotte.fr en précisant dans le titre du mail la mention « Stage M2 Bioindication Eponge » avant le 10 novembre 2024.
BIBLIOGRAPHIE
1. Bailey RC, Linke S, Yates AG. Bioassessment of freshwater ecosystems using the Reference Condition Approach: comparing established and new methods with common data sets. Freshw Sci. déc 2014;33(4):1204‑11.
2. McNellie MJ, Oliver I, Dorrough J, Ferrier S, Newell G, Gibbons P. Reference state and benchmark concepts for better biodiversity conservation in contemporary ecosystems. Glob Change Biol. déc 2020;26(12):6702‑14.
3. Menezes S, Baird DJ, Soares AMVM. Beyond taxonomy: a review of macroinvertebrate trait‐based community descriptors as tools for freshwater biomonitoring. J Appl Ecol. août 2010;47(4):711‑9.
4. Theroux S, Mazor RD, Beck MW, Ode PR, Stein ED, Sutula M. Predictive biological indices for algae populations in diverse stream environments. Ecol Indic. déc 2020;119:106421.
5. Bailey RC, Norris RH, Reynoldson TB. The Reference Condition Approach: In a nutshell. In: Bioassessment of Freshwater Ecosystems [Internet]. Boston, MA: Springer US; 2004. p. 145‑52. Disponible sur: http://link.springer.com/10.1007/978-1-4419-8885-0_7
6. Reynoldson T. The Reference Condition: A Comparison of Multimetric and Multivariate Approaches to Assess Water-Quality Impairment Using Benthic Macroinvertebrates | Journal of the North American Benthological Society: Vol 16, No 4 [Internet]. 1997. Disponible sur: https://www.journals.uchicago.edu/doi/10.2307/1468175
7. Corse E, Bozec CL. Rapport d’étude -Projet EpoDic- Implications des assemblages d’éponges pour la bioindication du littoral lagonaire de Mayotte. 2022; Disponible sur: https://rgdoi.net/10.13140/RG.2.2.22784.71681
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