La description complète est disponible sur : https://ofb.gestmax.fr/2876/1/analyse-des-reponses-biologiques-au-regard-de-la-qualite-des-cours-d-eau-bretons-h-f
Activités principales
Utiliser les jeux de données proposés pour effectuer des analyses des listes biologiques en fonction des pressions de qualité d’eau identifiées dans le cadre du calcul de l’état des eaux (Directive Cadre sur l’Eau DCE).
Les données utilisées seront issues du réseau de stations de la DCE.
Contenu du stage :
Affiner le périmètre de l’étude : choix des stations ayant des données biologiques disponibles (macro invertébrés et diatomées) pour la période de 2008 à 2023 (Réseaux DCE RCS et RCO) ;
Analyser les réponses biologiques aux pressions sur la qualité d’eau (notamment nutriments et matières organiques) à différentes échelles : indice invertébrés multimétrique (I2M2), indice biologique diatomées (IBD), métriques issues de l’I2M2 et de son outil diagnostic associé, variabilités taxonomiques ;
Ces premiers éléments permettront d’affiner territorialement les diagnostics écologiques émis par la surveillance de la DCE, et émettre des hypothèses sur l’expression des pressions en nutriments au sein de l’écologie des cours d’eau bretons et les confronter aux pressions identifiées lors de l’état des lieux DCE, en s’aidant les hypothèses formulées lors d’études précédentes ([2], [3], [4]). D’autres études pourront également être mobilisées ;
D’autres éléments devront être mobilisés en fonction de l’avancée du stage : morphologie, taille du bassin versant, autres analyses physico chimiques et pesticides.
L’OFB dispose à cet effet de plusieurs jeux de données :
-Des échantillonnages pluri-annuels des macro invertébrés et diatomées sur un réseau de stations en rivière (réseau DCE) ;
-Le réseau hydrographique et la délimitation des bassins versants ;
-Des analyses physico chimiques sur le même réseau de stations que pour l’hydrobiologie ;
L’ensemble des analyses et documents produits durant le stage respectera les principes de reproductibilité et d’ouverture du code comme des données [1].
Bibliographie
[1]. Wilkinson MD, Dumontier M, Aalbersberg IjJ, et al. 2016. The FAIR guiding principles for scientific data management and stewardship. Sci Data 3: 160018.
[2]. Carayon et al. 2019 Defining a new autoecological trait matrix for French stream benthic diatoms, Ecological Indicators 103 650–658.
[3]. J. Tison-Rosebery 2022 Decadal biodiversity trends in rivers reveal recent community rearrangements 823 153431.
[4]. Floriane Larras 2017 Assessing anthropogenic pressures on streams: A random forest approach based on benthic diatom communities Science of the Total Environment 586, 1101-1112.
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