Ingénieur-e d’études en traitement et analyses de données d’expérimentation

Ingénieur-e d’études en traitement et analyses de données d’expérimentation
BAP A : Ingénieur-e biologiste en traitement de données – A2A41

Contexte
Au sein de l’Institut Diversité, Écologie et Évolution du Vivant (IDEEV, Gif-sur-Yvette, France), les laboratoires
Génétique Quantitative et Évolution – Le Moulon (GQE Le Moulon) et Évolution Génome Comportement Écologie
(EGCE) collaborent dans le cadre du projet de recherche PHENOFORE1 (financé par le SEMAE). Ce projet vise à
étudier le rôle de la phénologie dans les interactions plante/ravageur/parasitoïde afin de proposer des stratégies de
contrôle des ravageurs alternatives à la lutte conventionnelle. Il porte tout particulièrement sur la sésamie, Sesamia
nonagrioides, et la pyrale, Ostrinia nubilalis. Il s’agit de lépidoptères foreurs de tige et ravageurs majeurs du maïs
en Europe. Afin de représenter la diversité phénologique du maïs, deux sources de matériel biologique ont été
utilisées dans le projet : 1) une collection de lignées de maïs choisie pour représenter la diversité du maïs2, 2) des
lignées issues d’une expérience de sélection divergente sur la date de floraison menée au laboratoire GQE-Le
Moulon3.
Les interactions entre maïs et foreurs de tiges peuvent être étudiées à travers plusieurs approches
expérimentales. Dans ce projet, nous avons étudié la préférence de ponte des femelles de sésamie selon la lignée en
condition semi-naturelles (cages 18m2). Nous avons identifié et quantifié également les composés organiques
volatiles (COVs) des plantes de différentes lignées testées en cage par GC-MS afin de les mettre en relation avec la
préférence de ponte. Pour lier la préférence des femelles à la performance des larves, l’appétence des larves de
sésamie pour ces lignées de maïs a été étudiée4 à l’aide d’un dispositif permettant de suivre la consommation de
disques foliaires par des larves de lépidoptères 5.
Références :
1 http://moulon.inrae.fr/en/news/2020/06/phenofore-un-projet-de-recherche-sur-la-lutte-biologique-contre-la-pyrale-et-la-sésamie-deux-ravageurs-du-maïs/
2 Cañas, R. A. et al. (2017) Exploiting the genetic diversity of maize using a combined metabolomic, enzyme activity profiling, and metabolic modelling
approach to link leaf physiology to kernel yield. The Plant Cell 29, 919–943.
3 Durand, E. et al. (2012) Flowering time in maize: linkage and epistasis at a major effect locus. Genetics 190, 1547–1562.
4 Sanané, Inoussa (2020) Étude des composantes de la dynamique de l’interaction entre le maïs et les insectes lépidoptères foreurs de tige. Thèse doctorale.
5 Sanané, I., Legrand, J., Dillmann, C., & Marion-Poll, F. (2021). High-throughput feeding bioassay for lepidoptera larvae. Journal of Chemical Ecology,
47(7), 642-652.

Mission
En étroite collaboration avec ses encadrants, l’agent recruté aura comme mission principale le traitement et l’analyse
statistique des données issues de ces expérimentations afin d’étudier les variations selon les lignées de maïs de
l’appétence des larves de sésamie, du choix de ponte des insectes adultes, et de l’abondance des COVs émis par les
plantes de maïs. Ces résultats pourront également être mis en relation avec des résultats obtenus lors d’expériences
d’infestation naturelle aux champs sur les mêmes lignées de maïs. En fonction de l’avancement des analyses et du
goût du candidat pour les approches expérimentales, une éventuelle mission secondaire consistera en l’amélioration
du dispositif haut débit pour mesurer la consommation des larves de lépidoptères en condition de choix.

Activités principales
– Prendre connaissance de la littérature nécessaire à la compréhension de la problématique du poste.
– Définir et mettre en oeuvre les analyses statistiques appropriées à chaque question biologique et chaque jeu de
données.
– Contribuer à la rédaction d’un article scientifique.
– Le cas échéant, poursuivre le développement et le test d’un dispositif de mesure de la consommation foliaire par
des larves.

Compétences
– Maîtrise de l’analyse statistique de jeux de données réelles.
– Maîtrise du langage de programmation R.
– Connaissances en modélisation statistique.
– Intérêt pour la biologie et l’écologie.
– Capacité de travail en équipe, dans une équipe interdisciplinaire.
– Maîtrise de la langue anglaise pour la lecture et l’écriture : B1 à B2.
– Sens de l’autonomie, de la rigueur et bonne capacité d’organisation.

Formation
Bac+5, Master 2 ou ingénieur

Environnement du poste
 Lieu du stage : Laboratoire EGCE, site IDEEV, 12 route 128, 91190 Gif-sur-Yvette
 Durée du poste : 6 mois à partir de Janvier/ Février 2025
 Rémunération : selon la grille en vigueur

Modalité de recrutement
CV et lettre de motivation à envoyer à Taiadjana Fortuna (taiadjana.marquesfortuna@ird.fr), Judith Legrand
(judith.legrand@inrae.fr) et François Rebaudo (françois.rebaudo@ird.fr) avant le 31/10/2024.