Sujet stage Master 2 – Biologie de la Conservation
** Contexte scientifique **
Le projet « Déclinaison nationale de l’approche EDGE » s’inscrit dans le nouveau cadre mondial pour la biodiversité qui introduit l’indicateur EDGE (Evolutionarily Distinct and Globally Endangered). Cette métrique permet de prioriser les espèces en combinant leur caractère évolutif distinctif et leur risque d’extinction. Le projet vise à décliner l’approche EDGE à l’échelle du territoire français, à cartographier les zones à forts enjeux pour la préservation de l’histoire évolutive, et à promouvoir la conservation de la diversité phylogénétique auprès de tous les publics. Une méthode de déclinaison adaptée à la configuration territoriale française a été développée au cours de la première année, en s’appuyant sur les oiseaux. Une liste de 160 espèces d’oiseaux classées EDGE à l’échelle nationale est désormais disponible pour la recherche (Campana et al. sub.).
** Objectifs **
Ce stage s’inscrit dans l’un des volets de ce projet. Il a pour objectif de fournir des données et des connaissances sur les pressions subies par les espèces d’oiseaux classées EDGE à l’échelle nationale, afin de contribuer aux stratégies françaises de conservation de la biodiversité. Il s’agira d’affiner les connaissances sur les pressions pesant sur ces espèces, en identifiant les critères et les données utilisées pour définir chaque catégorie de menaces. L’enjeu sera ensuite de déterminer quelles menaces sont associées à chaque territoire, ainsi qu’à chaque statut d’espèce (nicheuse, hivernante, migratrice, etc.).
** Rôle du/ de la stagiaire dans le déroulement du projet **
Le/la stagiaire contribuera au volet analytique du projet. Il/elle recherchera les données sur les menaces dans les bases de données de l’UICN, et les compilera avec celles de la liste de 160 espèces d’oiseaux classées EDGE à l’échelle nationale. L’objectif sera d’établir une liste des menaces spécifiques pesant sur ces espèces dans les différents territoires français. Il/elle réalisera l’extraction, la manipulation et l’analyse des données dans l’environnement R, dont l’usage lui sera enseigné au cours du stage. En complément du mémoire de Master, le/la stagiaire pourra également participer à la rédaction d’un article scientifique destiné à la valorisation de ce travail.
** Missions **
– Rechercher, à partir de la classification UICN, les menaces identifiées pour chaque espèce EDGE présente sur les différents territoires français, en utilisant des packages R d’extraction et de compilation de données
– Établir une liste de ces menaces (e.g., modification des habitats, chasse, pollution, espèces exotiques envahissantes)
– Quantifier et déterminer l’importance relative de chaque menace pour ces espèces
– Quantifier la fréquence des grands types de menaces selon le statut des espèces d’oiseaux
– Comparer l’importance relative des menaces entre les différents territoires français, en utilisant des analyses de correspondances
– Analyser si des facteurs macro-écologiques (e.g., climat, latitude, longitude, aire, etc.) influencent la répartition des espèces identifiées et le niveau des menaces qui pèsent sur elles à l’échelle nationale
** Corps encadrant **
– Dre. Roseli Pellens, ISYEB, Ingénieure de recherche, porteuse de projet
– Dre. Julie Campana, ISYEB, Postdoctorante, co-porteuse de projet
** Profil recherché **
– Formation : niveau Master 2 en biodiversité, écologie, évolution
– Connaissances : phylogénie, espèces menacées, écologie, écologie évolutive, biogéographie, macro-écologie
– Maîtrise des logiciels bureautiques
– Intérêt pour les politiques publiques pour la conservation de la biodiversité apprécié
** Modalités de recrutement **
– Type de contrat : stage
– Durée : 4 mois
– Rémunération : gratification légale de stage
– Date de prise de fonction : 2 février 2026
– Lieu : Institut de Systématique, Évolution et Biodiversité (ISYEB), Jardin des Plantes (MNHN) – Paris
** Modalités de candidature **
Pour candidater, merci d’envoyer CV et lettre de motivation par email aux adresses ci-dessous :
– roseli.pellens@mnhn.fr
– julie.campana@mnhn.fr
** Références bibliographiques **
Pellens Roseli & Grandcolas Philippe (eds), 2016 — Biodiversity Conservation and Phylogenetic Systematics: Preserving our evolutionary heritage in an extinction crisis — https://link.springer.com/book/10.1007/978-3-319-22461-9
Faith, Daniel P. 1992 — Conservation evaluation and phylogenetic diversity. Biological conservation, vol. 61, 1, p. 1-10 — https://doi.org/10.1016/0006-3207(92)91201-3
Isaacs Nick J.B., Turvey Samuel T., Collen B, Waterman Carly & Baillie Jonathan E.M., 2007 —Mammals on the EDGE: Conservation Priorities Based on Threat and Phylogeny. PLoS ONE issue 3, e296 — https://doi.org/10.1371/journal.pone.0000296
Gumbs Rikki, Chaudhary Abhishek, Daru Barnabas H., Faith Daniel P., Forest Félix, Gray Claudia L., Kowalska Aida, Lee Who-Seung, Pellens Roseli, Pipins Sebastian, Pollock Laura J., Rosindell James, Scherson Rosa A. & Owen Nisha R., 2023 — Indicators to monitor the status of the tree of life. Conservation Biology vol. 37, n° 6, e14138 — https://doi.org/10.1111/cobi.14138
Matthews, T. J., Triantis, K. A., Wayman, J. P., Martin, T. E., Hume, J. P., Cardoso, P., … & Sayol, F., 2024 — The global loss of avian functional and phylogenetic diversity from anthropogenic extinctions. Science, 386(6717), 55-60 — https://doi.org/10.1126/science.adk7898
Robuchon Marine, Pavoine Sandrine, Véron Simon, Delli Giacomo, Faith Daniel P., Mandrici Andrea, Pellens Roseli, Dubois Grégoire & Leroy Boris, 2021 — Revisiting species and areas of interest for conserving global mammalian phylogenetic diversity – Nature Communications vol. 12, n° 1, p. 3694 — https://dx.doi.org/10.1038/s41467-021-23861-y
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